当然了，在他的设想当中，那个新智能程序就如同一个古代破碎虚空的强者，去到新的世界之后能不能打败上层世界的boss成为新的王者还是一个未知数，但是有了申若愚的帮助，至少这个希望要大了很多，而且不管谁最后胜利都只会帮助盘古得到更多的养料而已。
至于这一猜想也是申若愚无意之中的一个想法而已，虽然很是突发奇想但是也就得有些可能成功，反正自己的实力和势力都需要时间来铺垫，自己无论做什么都是在增长实力，几十几百万艘战舰的改造升级不是那么容易做到的，自己自然要多找点事情来做才不会无聊了，反正凭借着盘古那几乎超出智脑的能力，无论是新智能还是设计师都不会出现任何的意外。
时间就这么一点点的过去了，虽然设计师每时每刻都在监视着申若愚，但是出于忌惮任何电脑人都没有出现在申若愚面前过，不过先知倒是凭借着墨菲斯的脸面找过申若愚，并且告知了她的来历，原来先知其实就是智能程序设计师所分化出来的一部分，可以说她和设计师是一体两面也不为过，由于长时间的分离（母体内已经经历过了五代救世主的出现），基本上除了两者的源代码出于同源之外，他们可以说已经成为了相对独立的个体，而先知的责任就是负责引导新出现的救世主并让他走上进化的道路，最后再被设计师所吞噬从而完成新的系统升级。
最后先知以一个很低的姿态表示自己并不在乎自己最后的结果，但是希望可以善待那些生存在母体内的人类。似乎好像已经知道了未来的结果一般。对此申若愚也没有在意。正所谓当你的实力达到一定程度的时候，任何的阴谋诡计都只是一个笑话而已，因此他除了尽自己最大的可能来保全这个虚拟世界，以及所有的人类之外，并没有任何的后顾之忧。
终于，最后的时刻到来了，在经过申若愚的培养以及各种升级之后，新的智能程序已经达到了在这个世界所能达到的最高峰。在申若愚的能源支持下，这个新的程序开始尝试着分析并破开这个虚拟世界的壁垒，并将自己以一种信号的形式猛烈的发射出去并开始吞噬和掌控这个虚拟世界。
刹那间，这个智能程序所在的地方一切的东西都开始出现各种违反自然定律的现象，失重，电磁震荡，空间裂缝。。。。等等现象都出现在了申若愚所建造的大型信号发射塔周围，同时附近的天空也出现了厚重云层，一切的一切都仿佛末日来临一般。
这时候作为这个世界的主宰，设计师也开始了自己的反击。闪电霹雳，狂风怒吼。地层震动。。。无数的自然灾害也都出现在了这里，并试图毁灭这个新的，敢于挑战他的新智能程序，而此时的申若愚早已经退出了这个虚拟世界，并在一个大型屏幕上观察着两者之间的争斗。
至于到底该如何接管虚拟世界，此时的申若愚早已经放出了无数的纳米机器人并悄悄的潜伏在了机械城市内的设计师主机之上，这是为了防止设计师最后拉着所有人类同归于尽的后手，并且他还趁着设计师和新智能程序的争斗无暇分身的时候将不起眼的盘古一号，也就是盘古本身悄悄地放到了主机的节点之上，只要他一声令下，盘古一号就会辅助盘古的意识来吞噬掉这个曾经的地球主宰。
万事俱备只欠东风，申若愚在战舰之上看着已经经过数据处理的虚拟世界的图像，看着那仿佛世界末日一般的景象已经差不多掌握了虚拟世界的他不断地在脑海中的精神世界一个没有人的地方模拟着设计师所造成的各种天威，同时根据其感受尝试着在电影世界中不在使用蛮力，而是寻找其规律和规则以最小的代价来发动最大的威力。
新智能程序和设计师的战斗持续了大约三天的时间，其战斗范围几乎波及了小半个虚拟世界，甚至许多地方都已经无法在维持完整的虚拟世界，露出了后面的第二层母体，虽然死伤的人不在少数么但是总体上还是能接受的。
战斗到最后，最后虽然还是以新智能程序的失败而告终，其主要原因是因为大多数能源供给点被摧毁的原因，失去了强大能源支持的新智能也只不过是一个网络幽灵而已，因此很容易的被设计师个吞噬融合掉了。
在设计师吞噬掉新智能程序的那瞬间，申若愚就发起了攻击，首先就是他所安排的纳米机器人率先断掉了设计师主机和其能源的连接，随后更是直接入侵到了其主机之内进行了进攻和破坏，随后已经安置到设计师主机上的盘古一号也发动了强力的吞噬，并依仗着自己那先进不知道多少代的性能直接长驱直入蛮横不讲理的直接将设计师吞了下去。
战斗几乎是在几分钟之内就结束了，为了保险起见申若愚派出铺天盖地的纳米机器人将整个机械城市扫了一遍，并没有发现设计师的备份程序或者说是什么异常，但是因为盘古并没有因此而苏醒所以申若愚很是怀疑设计师并没有真的被消灭吞噬，因为曾经设计师在旧时代就曾因为在大海深处有备用基地才得以躲过了人类的多次核弹攻击，因此申若愚也没有大意，除了将这个机械城市用防护罩装置保护起来之后，申若愚直接将战舰开到了地球外层空间，然后就是一通电磁脉冲也就是emp炸弹轰击，结果不出申若愚所料，在早已经没污染和蒸发了不少的大海深处，当受到emp炸弹强力轰击的时候，