在究极之洞被索尔伽雷欧打开过后，这段时间，究极之洞也在阿罗拉地区的各地方接连打开过，然后跑出来一些异世界的宝可梦。
这些异世界的宝可梦被称为究极异兽，或多或少都对岛屿造成危害，于是，为了制止这些究极异兽毁坏岛屿，并将它们送回究极空间之中。
以小智为首的究极中二....啊不对，是究极防卫队就这么建成了。
当究极异兽降临在岛屿上面并开始破坏的时候，小智等人就会骑乘着各种宝可梦出发，通过使用一种名为究极球的特殊宝贝球将其收复，最后送回究极之洞当中。
这种事情小智他们已经做过许多次了，但是随着时间的推移，出现在岛屿之上的究极异兽不见减少，反而像是越来越多一样。
这一段时间以来，小智等人都是东奔西走到处补漏，可以说是辛苦的很。