转眼间，三年过去了，在这三年里，小智也学会怎么使用波导，这是一个很大突破。
“小智！明天就是你成为训练家的日子了，你早点睡觉，明天别迟到了。”小百合站在小智的房门外，对着小智说道。
“安啦安啦，我这个看完就中小智做的事，看比赛。明天就要获得神奇宝贝了，想想都觉得不可思议！
这一夜，小智彻夜未眠。。。
第二天。。。。
“小智！现在已经八点半了！你已经迟到了！你是不想成为神奇宝贝训练家了吗？”睡梦中的小智突然听到一个声音，“这声音好像妈妈哦。”小智还在睡觉。
“啊！”突然小智惊呼一声，原来是小百合抽走了小智的被子，还去厨房拿了几块冰。。。
“天！已经八点半了啊！我居然迟到了！”小智没有理会放在他身上的冰，立即起身，急匆匆地跑出了门。
——————大木研究所——————————
“呼呼！终于到了！”来着便是小智，此时的他满头大汗，只有上的气没有下的气。
“哟！这不是小智嘛！怎么现在才来啊！”小茂靠在门口，轻蔑地说道，“我还以为你不会来了呢！哦，对了，三只初始的神奇宝贝已经被领走了哦，你可能得等明年了！哈哈哈！”小茂说完，哈哈大笑起来。“哼！”小智不理会小茂神经，冷哼一声，不再理会。“呀！我的女朋友们来了，小智，我就先走喽！”一辆十分豪华的汽车开了过来，车上有大概十几个女孩，都在喊着：“小茂小茂你最棒！”小茂朝着车子走去，立刻开车离开了。小智不禁一脸黑线，话说，小茂这么多女朋友，他的肾，不虚吗？小智摇了摇头，走进了研究所。
“博士，我来领神奇宝贝了！”小智对着正在写研究报告的大木吼了一声，吓得大木博士的笔都掉地上了。
“哦！是小智啊！你怎么才来，小茂和其他两个训练家已经出了！”大木博士无奈地摆了摆手。
“啊！大木博士，那快给我选神奇宝贝吧！”小智一听，立刻激动道。“好吧，这里有三只神奇宝贝，分别是小火龙，杰尼龟，妙蛙种子。。。”大木博士按了一个按钮，只见中间一个圆台上升起来三个宝贝球。
“我已经决定好，要杰尼龟！”小智说着拿起杰尼龟的神奇宝贝球，可是放出来后，是空的。
“额，妙蛙种子也不错！”小智放回杰尼龟的神奇宝贝球，又拿起妙蛙种子的神奇宝贝球，结果还是空的。
“既然如此，就选小火龙吧！”可是，最后一个还是空的。虽然小智已经知道会是这种情况了，但还是感觉十分不爽。
“那个，小智啊，今年准备给新人训练家的三只神奇宝贝都被选走了，所以，你还是明年再来吧。”大木有点尴尬地说道。
“啊～～～～博士，给我一只神奇宝贝呐，你这里这么多，就给我一只嘛，求求你了，也真的想成为神奇宝贝训练家呐，我等了这么久才等到今天，你就给我一只呐～”小智不断地对大木撒娇，有多恶心就有多恶心，吓得大木博士鸡皮疙瘩都掉了一地。
“好啦好啦，是还有一只呐，不过这一只有点问题。”大木无奈道。
“没事的，我要了，博士，快给我吧！”小智激动道。
“好啦好啦，小智别激动啊。”大木博士说着按了另一个按钮，从之前那个圆台中间又升起了一个带着闪电标志的神奇宝贝球，大木拿起宝贝球打开，白光一闪，一只背上有些棕色条纹，两条黄色带黑色的长耳朵，闪电形状的尾巴，脸上有两个电气颊的神奇宝贝出来了，没错，这就是一直陪伴小智的皮卡丘。
“皮卡丘！”皮卡丘叫了一声，伸了一个懒腰。
“博士！这是皮卡丘！”小智前世虽然经常在电视上看得很多次皮卡丘，但是真正出现在眼前多多少少有些激动。
“嗯，这是皮卡丘，不过它有点小问题。”大木淡淡地说道。
“没事的，不就是不喜欢进宝贝球嘛，大不了我让它坐在我肩膀上一起走啊。”小智有些激动地说道。此时皮卡丘却用一种异样的眼光看着小智。
“哦？你知道它不喜欢进宝贝球？”大木疑惑地问了句。
“额，这个。。。对了，博士，我的图鉴呢！”小智总不能说是前世从电视上看到的吧，于是赶紧找了个借口。
“哦！对了，差点忘了。小智，这是给你的图鉴，它可以自动记录你见过的神奇宝贝，还有一些功能就只能你自己去开了。”大木博士从口袋里掏出一个红色的手机样的东西，交给了小智，接着从另一个口袋里拿出五个宝贝球，“这是神奇宝贝球，你可以用来收服野生的神奇宝贝，用它来增加你的伙伴吧。”大木说着将宝贝球递给了小智。
“博士，请把我的图鉴升级为全国模式吧。”小智收下宝贝球，把图鉴递给了大木博士。“好吧。”大木博士带着诧异的目光从小智手上接过图鉴，在电脑前忙活了一阵，再次还给了小智。
“谢谢博士了，我就先出了！博士再见！”小智说着抱起了皮卡丘，本以为皮卡丘会电他的，可是皮卡丘却不像原著里面电小智，而且有些惊异。
“小智，你就要离开家了，你要记得带。。。（此处省略1ooo个字），每个男孩子都有离家的时候，那么，小智，加油吧！”小智刚出研究所，就被自己的老妈叮嘱了