这时其他金军的战船也发现自己的旗舰起火，顿时士气大落。而且也没有了指挥，金军的战船也不知下一步该如何是好，只能凭着各船自己的感觉行事，结果顿时大乱起来。宋军趁机向金军发起了猛烈的进攻，打得金军的战船连连起火。
而李公佐指挥巨大方船阵也缓缓在战场中横扫而过，由六艘大小神舟和十艘两千料战船组成的第一列横排遇的金军战船之后，先是一阵弓箭炮子的猛打，只打得对面船上的金兵无法招架，伏尸遍甲板，等宋军的第一列战船穿过之后，后面的战船立刻靠上来，搭住船舷，辅上跳板，无数身穿软甲的宋军手持利刃，蹬上甲板，与金军白刃作战，一直到金兵束手就擒，或是被全部斩杀干净为止。
宋军的方阵就像一根巨大的圆木，在海上辗过，所遇到的金军战船无不被辗得粉碎。虽然抹然史乞塔这时以往登上另一艘大型船，但整个金军的阵势以乱，根本就指挥不灵了。抹然史乞塔见况，知通金早败势以成，自己如果硬撑下去，只有全军覆没，因此只好下令撤退。而剩下的金军见状，更是无心再战下去，纷纷都调转船头，各自逃命去了。
李公佐立刻指挥着宋军随后穷追猛打，一刻也不放。一直追到剩下的金军战船只得全部退入三门湾的水寨中避难。宋军这才等止了追击，退回到东箕列岛的临时驻地停泊。
这一战金军一共损失了大小战船一百三十三艘，其中有包括旗舰在内的大型楼船四艘，两千料中型楼船十八艘，一千料战船六十五艘，还有六十多艘战船，受了不同程度的伤损，需要修理。战死士兵六千余人，另有三千多名伤兵。
抹然史乞塔这才知道宋军水战的厉害，怪不得金军历来在水上都找不到宋军多少便宜，从此之后再也不敢小视宋朝的水军。立刻下令紧闭寨门，严加防守，不敢再出战了。一心兄等着庆元府的援军赶来，合力对付宋军。
宋军得胜之后,并没有进攻三门湾的金军水寨,而是回到东箕列岛的驻地停汨，毕再遇下令全军欢庆。不过在查点战船之后，李公佐却有些笑不出来，这一战中宋军居然也被金军击沉了四十二艘大小战船，包括三艘两千料战船，十七艘一千料战船。阵亡将士一千余人，还有二十多艘战船受伤,暂时失去了战斗力，因为宋军远离自己的水寨，人手工具都不因此伤船之中，恐怕有一半都难以修好。
虽然宋军的损失只相当于金军的三分之一左右，但除了此前的东海一战,是因为众寡实在太过悬殊之外，大宋水军还从来没有过在那一次与金军的战斗中,会损失这样多的战船。无论是当年的陈家岛之战, 还是后来的福山岛之战，金军的损失至少都超过了宋军五倍。
而且从战事的进程来看，如果不是因为这一战宋军有铁甲船，或者如果不是因为铁甲船的突袭，击毁了金军的旗舰，那么就算这一战宋军依然能够获胜，但付出的伤亡还将会更大。
由此可见，在这一次南侵中，金军的水战能力确实有了长足的进步，因此选择从海上突势大宋，说明这几年来金军在花大力训练水军。虽然目前金军的水战还不足以赶上宋军，但以经不容小视了。
而且海上第一战虽然是胜了，但现在金军的战船还是远多于宋军，而且宋军又是远离自己的水军基地作战，再后面的战斗中，如果稍有不慎，只怕就会令宋军陷入困境。因此李公佐暗暗提醒自己，绝对不能因为初战告捷而放轻警惕，后面的战斗必须要计划周详。
好在这一战中，宋军一共俘虏了金军大小战船三十五艘，其中有二十二艘都基本完好无损，可以立即编入宋军的船队中使用，俘虏的战船中，有二艘是两千料战船，有十四艘都是一千料战船。这样一来宋军实际的损失并没有表面上那样大，总体的战斗力也基本没有受到多大的影响。
随后几天，金军都不敢出战。李公佐知道他们是在等待庆元府的援军，因此也没有去强攻金军的水寨，只是停泊在东箕列岛中，一面重新整编新的战船编制，一面又命人抓紧抢修受伤的战船。又派人去催促后勤船队，赶快赶到，同时也派人严密监视兴元府金军水军的动景，准备迎接下一次大战。
就这样双方罢战了数天之后，李公佐和抹然史乞塔几乎时同时接到消息，金国的水军都统制苏保衡率领着金军的援助船队，以经接近了三门湾海域。
苏保衡出任金国的水军都统制多年，早在大定初年（1161年）的陈家岛海战起，就开始和宋朝的水军打交道了。他可是深知宋朝水军的厉害，也知道东海一战，金军其实是以多胜少，而且还是惨胜，并不表示大金的水军从此就能和宋朝相抗了，因此他始终都保持着谨慎小心的态度，和在此之前抹然史乞塔的盲目乐观自信可截然不同。
在接到了抹然史乞塔的求援之后，苏保衡立刻意识到，这一次宋朝水军绝不会是小打小闹。因为他对当前战局的认识比抹然史乞塔要清楚得多，现在宋朝夺取了淮西，取得了战场上的主动权，各条战线的金军都被迫退较为防守，宋朝没有理由在最具有优势的水军上还一直按兵不动。因此宋朝的水军不来则矣，一来必然是以雷霆万钧之势，直击大金的水军。
因此虽