但他们却沒有想到，杨炎这一次其实根本就是一个幌子，其际上朝廷早已另外派出职方司的人着手调查事情的真像。就在王淮、魏杞、孙涛等人把注意力全部都集中到杨炎身上的时候，他们正有条不紊的在暗中查明了真像。
职方司成立一年多的时间，部门人手都以经十分齐备，为了查清真像，也下了很下一番功夫。其实想要查明真像到并不困难，真正难的地方是找到人证物证。因此才拖了一个多月之久。
对此由职方司的主事周信亲自主管这一任务，先从两个县的知县郑文意和袁奎下手。正好这两人心里也十分不忿，因为是在自己的县里闹出的事情，将来就算事情平息，自己的仕途也会大受影响，相反这到正是一个机会，如果能够帮助杨炎扳到魏杞、孙涛等人，到是一个晋升的好时机，因此权衡利弊，又经过一番交涉保证之后，两人不仅把自已所知的真像全盘托出，而且也愿意进京做证。
周信得知以后，十分高兴，但为了不打草惊蛇，让两人同时装病，假作是不配合杨炎的调查。然后又派遣人员，混入孙知行和林长富家里，一面收集证据，一面寻找可以作证的佃户。同时又派人假冒帐房先生的家人，哄骗说他们家中有事，骗出了两家的帐房先生，一阵威逼利诱之后，终于逼得帐房先生说出了两家隐藏土地挟户的事实。
至此所有的人证物证都以经收集齐全，只是为了不让魏杞、孙涛、王淮等人起疑心，才没有捉拿孙知行和林长富，不过以将两家严密监视起来。然后赵忱才下旨，诏杨炎等人，连同魏杞、孙涛一起回京，当殿旬问。
赵忱又开口，厉声道：“这次民变分明是有人为了逃脫隐瞒田产挟户，阻扰新法实行，而故意煽动的。魏杞、孙涛你们两人身为荆湖南路制置使、潭州知州，居然一是因办新法害民才引起民变，还有王淮，朕命你随杨炎去潭州查明真像，你就是这样查得吗！”
三个人吓得跪伏于地，身体如筛糠一般，一句话也说不出来。虽然刚才在金殿并没有上直接指证孙涛，但其他的文武大臣见了此情，也都明白，孙涛绝对是孙知行和林长富背后的直接指使，王淮和魏杞两人，只怕也脫不了干系, 而且这后面恐怕还会牵扯出其他大臣。现在只看皇帝是如果判决了。
这时陈俊卿出列，道：“陛下，微臣以为，此案事关重大，大殿之上并非审理之地，还是应该移交有司衙门，让刑部与大理寺联合审理，一定要审明真像，以召告天下。”
赵忱点了点头，陈俊卿说得到也没有错，便道：“好，就依丞相所奏。不过王淮、魏杞、孙涛三人无论与此事有无牵连，但以有失察之过，现将三人的官职全都免去，听候刑部与大理寺审查，等查明真像之后，再看其罪行大小定罪。另外荆湖南路的新法施行，也不容拖延，着吏部重新拟定人选，出任荆湖南路制置使，再交中书审议。刑部尚书施师点、大理寺卿陈良祐何在。”
施师点和陈良祐两人刚才在班列中早就把殿上的一切看得一淸二楚，听皇帝叫到自己，立刻出列，道：“臣在。”
赵忱道：“那么此案一干人证物证就都交于两卿审理。卿等当秉公而断，不得有误。”
两人忙道：“臣等尊旨。”