焦琏到了全州，陈邦傅的部下对他颇为忌惮，留在全州款待，焦琏却从他们的言谈之中发觉情况不对，索性盗了全州守将的文书印信，兼程赶奔桂林，焦琏部都是骑兵，全州守将追之不及，焦琏路过白石潭时，正碰上原本舒梦征以为被派往灌阳的那几百客军。这几百人其实根本没有去灌阳，而是就近隐伏在了白石潭。焦琏抓了个舌头，得知陈邦傅要他们乘木排顺江而下，与陈邦傅部下的柳州兵夹击桂林码头。这几百人当然不是焦琏手下三百陕西骑兵的对手，但是焦琏不想和他们纠缠，一把火烧了江边的木排，率部南下桂林。
在桂林城北休整半日之后，焦琏通过侦骑的报告大概摸清桂林面临的情况了。虽然别的不清楚，但是陈邦傅在攻城，郑茂华在守城这一点可以确定。尽管不排除郑茂华已经反叛，陈邦傅是去平叛的可能，可白石潭俘虏的口供证明陈邦傅有劫掠码头商旅的计划，这是确凿无疑的。因此，焦琏认定陈邦傅是反叛，便抢先突袭了东镇门，截断了陈邦傅的退路。
陈邦傅带兵反攻东镇门，离城门不远时，忽见对面一队骑兵冲来。陈邦傅仗着自己人多，下令依托街道两侧民房还击，他根本不知道，自己面对的是怎样的对手。
旧时空的清初史料，有这样一段记载：
王师从平乐长驱入桂林，虚无甲兵，瞿式耜召焦琏于黄沙镇，琏率骑三百人赴之。时山水汛溢，士卒从水中行百里，水及马腹，至江得渔舟二艇，次第渡之。初十日薄暮，抵留守府，式耜拊臂劳之。明日，王师数万猝至，一卒仓皇奔报，气急舌结，手东西指，式耜笑曰：“敌兵至耶？何张皇若是？”俄数十骑乘虚突入文昌门，登楼瞰留守署，矢集式耜纶巾，式耜叱曰：“何敢尔？”呼焦琏，琏袒臂控弦提刀至，发数矢应弦倒，琏士卒闭城门，王师之入城者不得出，绕城走。琏复杀数人，乃弃马越城下，琏三百人开门追之。王师自渡江来，未有抗衡者，见琏出，方错愕，而琏引骑直贯其营，左右斩首数千级，冲王师为三，已复合围之。琏大呼入，戈刃所及，血雨肉飞。诸将白贵、白玉，亦开城出，追奔数十里，桂林获全。论者谓南渡第一功也。
事实上，当时主要是因为岭南三忠起义，佟养甲召李成栋回广州镇压，桂林才得保不失，“斩首数千级”是没有的。这在明末清初都史料中是常态，“斩首数千级”已经算客气的，《江阴城守纪》还说江阴保卫战打死了清朝三个王爷，比李定国还牛。但是焦琏引三百骑驰援桂林，硬碰硬击溃李成栋的前锋部队是事实。旧时空的陈邦傅若不是以鸿门宴谋害焦琏，也绝不是他对手。焦琏部骑兵在陕西打过蒙古人，打过高迎祥、李自成，这些人都没让焦琏吃亏，区区一个陈邦傅又怎么可能在正面对决中打得过焦琏。只一炷香的工夫，陈邦傅的人马抱头鼠窜，陈邦傅知道事情不妙，急急忙忙整顿兵马，从安定门出城北退，焦琏也不敢拿骑兵和陈邦傅打巷战，击溃了他的攻势就算完，谨守东镇门。
陈邦傅的计划原本十分周密，按照一开始的构想，打下靖江王府和码头，杀死郑茂华之后，他就把桂林城交给柳州兵和白石潭的客军随意抢掠，自己带着亲兵和大部分财货退往全州。等宋军得到消息，前来桂林，他们会先碰上阳朔的那几百乌合之众，阳朔的老兵油子们一定奔回桂林散布恐慌情绪，柳州兵想要带着抢到的金银女人回家，而他们回家的方向上恰好有自己事先调到永福的桂林卫所兵，这些人得知桂林出事，也会回家，两拨回家的兵马半路撞上，柳州兵又满载从桂林抢来的战利品，势必火并，而阳朔、桂林的客军则会就地散去。趁着桂林、阳朔、永福周边打成一锅粥的时候，他就可以从容退到全州，这里的部队都是他部下桂林籍的士兵，隔着两百五十里，消息闭塞，他们并不知道抢掠桂林的事。到时候陈邦傅就告诉他们，澳洲人破了桂林，郑茂华献城投降，全州不能守了，全军去永州暂避。他事先已经把一些桂林兵的家眷接到全州了，愿意跟他走的也能有几百人，足够打破湖广明军的封锁，到了永州境内，他便推说没有军粮，让部队四下打粮，他则趁此机会，带着自己的亲兵和金银财宝间道前往长沙，然后回浙江绍兴老家安度晚年。至于在桂、永二府留下一片焦土，葬送几千兵卒、几万百姓，那就不在他的考虑之内了。
可是没想到，凭空冒出一个焦琏来，把他的计划全打乱了。火烧白石潭阻止了陈邦傅的客军增援桂林，东镇门之战又打破了陈邦傅的夺城计划。其他各门守军得知东镇门大胜，陈邦傅逃出桂林，都士气大振，而陈军一时收不到陈邦傅的联络，又听到陈邦傅已经被杀的谣言，未敢死拼，到第二天上午，都被逐出了城门，桂林城门封闭，成了一座铁桶。这时，步行前来的白石潭人马才姗姗来迟。
坏消息还不止这一个，儿子陈曾禹迟迟不归，多半是死了。尧山那边，没想到朱亨嘉早就收买了一群土匪，就驻扎在尧山上，本来是陈军在尧山下伏击朱亨嘉，现在却变成了朱亨嘉两面夹击陈军。双方在山道上一场混战，陈军精锐，朱军乌合，陈军倒也没吃什么亏，只是天色已晚，部队都打散了，朱亨嘉下落不明，陈军的溃卒之后两天才陆陆续续返回城北陈邦傅的营寨。陈邦傅军饷和赏银给得比较厚，又