柯南这下子明白了灰原和千钧的关系，怒火冲天，“开什么玩笑！你这种发明杀人药物的家伙，你要我怎么理解你？你以为我能像千钧那样信任你吗？”灰原吓了一跳，没想到柯南反应这么剧烈。之前千钧听完后，虽然有些吃惊，但还是很平静，二人的反应似乎颠倒了。灰原叹气，“因为千钧是我儿时玩伴加男朋友，所以我无论发生什么都能接受吗？工藤新一被我发明的药物弄成这样，也难怪他这么激动。”柯南怒道，“你到底搞清楚没有？因为你发明的那种毒药，害死了多少人啊！”
门打开了，千钧走了进来，“新一，你不要这么生气。就算不使用这种药物，他们一样会将那些人杀死的。这种药物就像枪械一样，我们不能责怪发明枪械的那些人。”柯南生气，“虽然你说的有道理，可是我还是很难原谅她！”灰原反击，“如果不是这药的特殊作用，世界上就真的没有工藤新一了。”千钧坐下来，让灰原靠在肩上，“好了，他太激动了，你别往心里去。”灰原幽幽叹气，“其实，我根本就不打算制造这种药物。”柯南怒道，“你还要狡辩？你既然知道千钧的消息，为什么不早点跟我们联络？”博士劝解，让柯南冷静一点。灰原苦笑，“其实我一直想单独去见见千钧。可是我身边时时有人监视，我的行动根本不自由。只要露出一点蛛丝马迹，连千钧都会被连累。”
千钧道，“好了，新一。小哀现在已经脱离那个组织了。你想想看，她既然是这种毒药的发明人，要制造解毒药就容易多了。这样，你恢复真身不就有了眉目吗？”博士赞成，“的确，这是个好机会。”柯南冷静下来，“你快点把解药弄出来，那样我就原谅你。”灰原坐在千钧腿上，“哪有这么简单，药物的资料都在研究所里。那么庞大的资料，人的脑子怎么可能记得住。”柯南犹如被泼了一盆冷水，“可恶！那你告诉我，那个研究所在哪里？”灰原跳下来，拿出一份几天前的报纸，“没用的，去了也一无所获。其实，那天晚上龙魂使者进攻后，组织在撤退时就摧毁了一切。”
柯南仔细看那份报纸，上面介绍的是一家制药工厂，报纸上只是写着神秘失火。秘密调查局早就封锁了消息，就算现在去了，什么也不会找到，弄不好还会引起调查局的怀疑。柯南不死心，“你们总有备用的据点吧？其他的那些呢？”灰原叹气，“跟我有关的机构都是一样的。组织担心我泄露消息，提前破坏了这些地方。”千钧道，“秘密调查局的那个朋友曾经告诉我，前一阵子他们有一次大行动，在很多地方造成了破坏。只怕有的地方是被调查局给摧毁的。”柯南问道，“那他们有没有找到什么？”千钧道，“那就不知道了。这么秘密的事情他怎么会告诉我。”
柯南道，“也就是说现在灰原也被……”灰原点头，“对，我想组织现在一定正在疯狂地到处找我。如果我被秘密调查局抓住，那事情就大条了。可不论是组织还是秘密调查局，都根本不知道我的身体变成这个样子。不过，组织继续拿这种药物作为暗杀手段的话，就很难说以后会不会出现像我们这样身体变小的案例。到那时候就麻烦了，组织还保留着我童年的资料，一定会尽力把我找出来的。”
柯南头疼，麻烦不是一般的大。灰原戏谑，“怎么样，我的大侦探？你会把我这个麻烦人物赶走吗？没错，我制造了杀人药物，参与了杀人计划，又遭到组织的追杀。对你来说，我是一个可恨又危险的人物。你跟千钧不一样，我们没有任何关系，你没有理由把我留在这里。”柯南哼了一声，“笨蛋，如果你被揭穿的话，我的事情穿帮也是时间问题。到时候，所有人都会一起完蛋。虽然对博士有些不好意思，不过，看在千钧的份上，你暂时还是留在这里继续当小学生吧！还有，你不要给我在外面乱晃惹麻烦。你要想快点成为千钧的女朋友，就拜托你尽快把解药制作出来。”
灰原笑道，“这一点上我比你好在意。好，那我们就合作愉快！”千钧笑道，“好了，以后大家就是一条战壕的队员，要彼此互相信任。”博士问道，“小哀，那你父母的安全怎么办？”灰原道，“这点你不用担心。我的父母本来就是组织的成员，他们在我出生后不久，就因意外去世了。”博士问道，“那你其他的家人呢？”灰原有些哀伤，“只剩下一个聚少离多的姐姐，和被迫去美国留学的我不同，姐姐一直留在日本过着普通人的生活。不过，一直被监视着。姐姐为了让我离开组织，才答应替他们工作的。但是，她能上普通的学校，交上普通的朋友，跟别人一样去旅行……可现在，她也不在了。”
千钧安慰道，“哈，不是还有我吗？我是你最好的朋友。”灰原哼了一声，“你少在外面勾三搭四就是好的。”千钧有些尴尬，“小哀，我向你保证，我会保护你的安全的。无论是什么组织，都不是我的对手。”灰原嘲笑，“你就是喜欢吹牛，你以为你是龙魂使者啊，能一个人对抗整个组织？”千钧不服气，“你怎么知道我不行？真是的……”柯南问道，“这个龙魂使者到底是什么人？怎么这么厉害？”灰原道，“天化组织的超级战士，但后来脱离了。这个人曾经几次攻击过黑衣组织，组织在他手上吃了大亏。传闻天化组织派出去追查的其他超级战士，都被他杀