无论鲛崎怎么逼问，鲸井死活不说实话。平次头疼，“这样下去，根本没完没了啊！”这时，毛利走了进来，“组长，我去问过船上的船员了。”鲛崎问道，“怎么样？”毛利翻看笔记，“每一个船员都有完美的不在场证明。刚才那起爆炸发生、箱子着火的时候，除了我们乘客之外，船长和所有的船员都是采取两人以上的方式行动的。也就是说，我们在这里听到类似枪声的声音时，赶到甲板上面查看后，才发生那起爆炸意外的。所以放火烧焦尸体的，应该是当时不在甲板的人才对。”
鲛崎道，“照你的意思，凶手只有可能是还没有现身的叶才三了。”千钧道，“不是吧，你们难道忘了吗？”矶贝笑道，“对哦，应该还有一个人。就是那个不舒服早早回到房间休息的龟田啊！之后，我就再也没有看到他了。”千钧道，“发生了这么大的事情，龟田都没有现身，毛利大叔，你不觉得奇怪吗？”毛利这才醒悟，“是啊！我怎么把他给忘了？”鲛崎恼怒，斥责毛利，“既然这样，快去他房里，把他给我叫到这里来！”小五郎大汗，答应一声急忙跑去了。
千钧站起来，“我也陪大叔过去，说不定这个龟田是个危险人物。”平次附和，“我也去。”柯南响应，“还有我！”三人就跟着毛利出去了，小兰喝止不住，“等等，柯南……”直子看出小兰有些害怕，笑道，“那我们也一起去吧！”小兰急忙点头，“对、对啊，我们去保护柯南……”二女也跟在后面，追了出去。毛利不满，“真是的，你干嘛跟着我啊？”小兰笑道，“又有什么关系嘛！”直子也道，“人多比较安全啊！”
驾驶室，船长已经跟小笠原方面联络过了，准备直接赶到小笠原。大副问道，“船长，你不打算折返吗？”船长点头，“放心吧，他们说了，明天一早就派直升机过来。我们这艘船上，还搭载了一定要送到岛上去的生活物资。一切准备就绪后，保安厅也会派船过来。在这之前，只有把这件案子交给那位名闻遐迩的大侦探了。”大副和另外两个船员也都赞同，毛利侦探的名声让大家很有信心。船长下令，“引擎启动，速度上升到20节。”轮船开动，继续上路了。
114房门外，毛利敲门，“龟田先生，龟田先生！”没有人回应，毛利道，“我看你们再去借把钥匙来好了。”千钧疑惑，“里面是不是没人啊？”伸手去拉门，发现门没锁。毛利非常尴尬，“这个……”毛利探头进去，“龟田先生，打扰一下……”千钧进去打开灯，果然里面没人在。毛利纳闷，“人不在房里，跑哪里去了？”
平次和柯南都有些吃惊，彼此对视了一眼。毛利还在翻看床上的物品，小兰道，“既然这样，还是快点去通知鲛崎叔叔吧！对吧，服部、千水？”可是回头发现，平次、千钧、柯南都不见了。直子苦笑，“他们一起跑出去了。”小兰生气，“真是的，他们在干什么啊？这件案子交给爸爸和鲛崎叔叔不就行了……”
这时，三人分开行动，开始调查船上的所有地方，平次还询问了一些船员。最后，三人在船尾处汇合，平次露出喜色，“怎么样，你们有什么收获？”千钧用手巾取出找到子弹壳，“下面的机房里，地板上有残留的血迹，还有手枪的空弹壳。”柯南捡到了一封信，平次也找到不寻常的纸片，“虽然被揉成一团当成了垃圾。”柯南问道，“你在哪里找到的？”平次道，“餐厅入口那里的洗手间处，我在垃圾桶里找到的。”
平次问道，“那封信上写了些什么？”柯南给他看，上面写着，“去机房等我，古川大。”平次道，“怎么又是古川大？血迹还有空弹壳……”千钧道，“这样看来，被烧死的人，应该是遇害者吧！”平次掀开了盖着的尸体，“不错，太阳穴上中了一枪，这的确是子弹的痕迹。”柯南道，“这个被烧焦的人物，先是看到了这封信，找到机房。在那里，被人用枪击中头部，才被放进这个箱子里面的。”平次道，“没错，我想应该是这个样子了。”柯南问道，“对了，你找到的纸上，写了什么？”
平次道，“我想应该和你捡到的那封信一样，都是用电脑打印出来的。”千钧看见平次完成的拼图，上面写着，“我们到船尾见，古川大。”平次道，“这就证明，有人刻意把鲸井引到甲板上来。”千钧疑惑，“你怎么知道这是写给鲸井的呢？”平次道，“因为有两个船员曾经亲眼看到，12点刚过时，鲸井就青着一张脸来到船尾，扯开喉咙大叫我来了。后来，有个船员跟他说话时，他还吓了一大跳。他叮嘱二人务必保密，不要告诉别人他来过船尾，然后就慌慌张张地回餐厅那边了。”
千钧道，“这么说起来，他是假装去洗手间，实际上是来了这里，然后才回去加入纸牌游戏的。”平次道，“在这之后，那两个船员以为会有别人来这里，就一直在这里等着，最后谁也没来。他们正想回去工作时，就听到上面的甲板传来了枪声。”柯南问道，“那个时候，箱子起火了吗？”平次道，“没有，当时箱子还没有起火。”千钧道，“会不会是定时装置？”平次摇头，“箱子里找不到任何自动引爆装置。”
柯南分析道，“也就是说，凶手先在上面的甲板制造枪声，接着又将旗帜点着，趁着大家赶到甲板上的空档，他跑到下面船尾这里，用火烧了