2月25日，孙瑾与芙蕾乘着宇航机回到了海里奥波利斯，由于共和国保持了中立，地球联合的战力遭到了削弱，战争一开幕就呈现了焦灼状态，克莱茵议长，在悼念“血染情人节”的牺牲者的国葬之际，发表《独立宣言》以及《对地球联合的彻底抗战》。（《黑衣（丧服）独立宣言》）。并且，对未参加联合军的国家优先提供物资（《克莱茵议长的积极中立劝告》）。非plant理事国的大洋洲联合、南美合众国接受此劝告。联合军对南美合众国武力侵略，对巴拿马宇宙港为军事镇压，南美大陆被并入大西洋联邦。
大洋洲联合，批判联合军侵攻中南美，并表明对plant的支持。亦即成为“亲plant国家”，联合军以其属盟国而对其宣战。
虽然对于共和国的中立地球联合并没有对其本土开战，但是共和国也失去了对太空中的资源卫星的控制权，考虑到秘密开发的量产ms并未完成，共和国只能先隐忍下来，好在拥有的资源卫星提供的资源缺失也在预计之内，单靠共和国在陆上的现有资源完全可以撑住，作为领导人的三位执政官在商议过后决定加快ms的开发以对抗地球联合。
回到学校的孙瑾二人被基拉几人围住询问，孙瑾安慰了几人，地球与plant虽然开战，但是奥布与共和国都是中立国，战火暂时还波及不到这里，听到孙瑾的回答，几个人放下心来，少年心性让他们很快就恢复成日常的样子，又开心的聊起了日常，看到他们的样子孙瑾在心中叹了口气，因为中立就放心什么的还是想的太美好了，在绝对的实力面前，中立是毫无作用的，只有自己的实力让人无法忽视，话语才有作用，看着基拉，孙瑾觉得应该在剧情开始前让他理解这些会更好一点。
就这样，在地球联合与plant打的不可开交的情况下，作为中立国隶属卫星的海里奥波利斯里的众人过着和平安逸的日子，仿佛外面的战争不存在一样。
日复一日，孙瑾在学校中过着没什么波澜的日常生活，而战争越发的激烈，plant将数量众多的中子干扰器散步到了地球联合的国家，导致了严重的能源危机，地球联合日渐贫乏，战争英雄也如剧情中那样出现在战场上恩底弥翁之鹰-穆·拉·佛拉达，沙漠之虎-安德鲁·巴尔特菲尔德以及幕后大黑手劳·鲁·克鲁泽。
（双方在l4交战一个月后，规模军事行动减少，但无论在地球上还是宇宙中，小规模冲突仍是不断，战局陷入胶着状态。）
宿舍里孙瑾坐在自己的位置，电脑终端上，主持人正在播报最近的局面名门谋婚之宠妻无度
孙瑾出了宿舍便跟自己的父亲联系
“怎么了小瑾突然联系我？”
接通后孙轩有些奇怪的问道
“父亲，奥布可能也在开发ms。”
“怎么回事？”听到儿子的话孙将军有些严肃的问道
“我从学校的下放的课题里发现了与ms操作系统有关的程序。”
接下来孙瑾说明了事情的原委以及自己的室友是一名调整者天才，孙将军听到自己的儿子与一名调整者是好友很是好奇，但现在还是集中思想考虑奥布开发ms这件事，考虑了一番，孙轩决定让孙瑾在学校多注意这件事，其他不要做，毕竟现在因为中立两国外交多了起来，现在还不宜刺探奥布，只是自己儿子的安危让孙将军担忧，如果奥布秘密制造ms这事属实，那么孙瑾和芙蕾在海里奥波利斯就不安全了。
孙瑾尝试着提出把自己的应龙高达运到海里奥波利斯里以防万一，孙轩认为太危险，把ms运到别国暴露后会引发很大的问题，而且一旦被抢夺ps装甲技术就会泄露，最后决定以保护孙瑾和芙蕾为由，与奥布联系，在海里奥波利斯内设置了大使馆并配备了一个武装小队，一艘天水级一号舰，三架ma。
作为新研发的宇宙用战舰
天水级一号舰天水号
全长260米，装备4门双联装光束炮，飞弹发射器8台。
没能说服自己的父亲把应龙高达送到自己这孙瑾还是很失望的，但是想了想现在还没找到奥布开发ms的决定性证据，孙瑾也只能先去找证据再说了。
连着几天，孙瑾跟着基拉一起参加了加藤教授的科研小组，但除了一开始给基拉的那份课题里有ms操作程序的一小部分外，孙瑾再也没发现与其有关的程序，于是他只能安下心来跟着基拉一起上课，知道了两人参加了科研小组，芙蕾也跟着报了名，米丽雅莉亚两人听到消息也参与了进来，于是五人同在一个小组的上课日子开始了。