民国九年十月，王茂如回到了长春，在国防军指挥中心总参谋部听取了副总参谋长雍星宝关于国防军精简的建议。经过总参谋部等多部门联合考察认为国防军的两万三千人师团制已经不符合时代潮流，太过臃肿导致指挥不便，尤其是现在国防军主力部队的武器弹药配备远超历史上的北洋军，因此不需要以人数多少来定胜负。
国防军的军制最初组建是袭成北洋陆军，而北洋陆军则是学习日本陆军，日本陆军则是学习德国陆军，均为二三制（即营以上二二制，营以下三三制）。可是这种编制在王茂如那里都变为为了三三制，因此国防军一个陆军师团远超正常的北洋陆军师。
北洋陆军师一个班组十五个人，配备十五支汉阳造或者德国委员会1888式步枪，国防军一个步兵班十三个人，配备一支轻机枪一支（或两支）冲锋枪十一支e1式快枪，由于e1式步枪是射击速度最快的步枪——如今的e1式步枪的设计速度已经远超他的母本李恩菲尔德步枪，这一点连英国人也不得不承认。对比一下火力，国防军一个班的火力可以抵得过北洋军一个排，如果是防御战，只要弹药充足可以抵得过一个连。强大的火力虽然让国防军的陆军师团强大无比，然而后勤却更加沉重起来，军队瘦身成了必须要做的事情。
国防军如今庞大臃肿的军事构成已经影响到了指挥，军官们迫切需要更加精干的部队。经过总参谋半年以来的研究，雍星宝认为三三制陆军应继续沿用，但是人员应该精简，尤其是班组战斗人员，十三个人的满员步兵班必须削减。未来的步兵满满员为十人，和平时期一个班只需要八人即可。另外强大的实力也带来了庞大的军事开销，给政府带来了极其沉重的财政压力，为了应对变革和改编财政支出比例，王茂如责令雍星宝对国防军进行精简。使得陆军师团更加灵活强大。
经过参谋部的推算认为，和平时期满员十人，即十个人作为一个标准步兵班，发生紧急战争时期可以扩充到十二人，其中两人属于新兵。现如今十三个人的步兵班。要减少三人。王茂如很是好奇。如此一来一支军队有多少人，能减少多少？不算不知道，雍星宝一番计算，和平时期一支陆军师团一万八千人。而当战争时期一个陆军师团会扩充为一万八千人至两万二千人。并教导团（补充团）理应从各支军队军队中独立出，划归给各军部直接管辖。
王茂如仔细考虑了参谋部的建议之后，终于下定决心对国防军进行瘦身行动。他批准了参谋部的计划，但要求精简下来的士兵并非真正退役，而是进入二线预备役部队。也就是武警或者警察部门，当战争时期可以迅速扩充非正规军。如今全国警察和武警都掌控在国防军手中，更加重要的是，由于在黑龙江省试实行了全民兵役制度，仅黑龙江一省，战争时期就可以动员六十万士兵。作为国防军参谋次长的雍星宝看到了全民兵役制度的好处，申请在吉林和辽宁同样进行全民兵役制度，王茂如听取财政处赵佳诚的建议后认为财政不足以支持，否决了该计划。
而在国防军指挥层内部。却忽然因为一条建议而引爆了国防军内部权力之争。总军务部副部长兼军校处处长卢方忽然在军事会议上提出，更改现如今国防军的师团制名称，效仿西方建立甲种师，舍去学习日本陆军的师团称谓。他的建议得到了个军团长的支持，但是却遭到了国防军总参谋部的反对。
这条建议在国防军引起了很大的争议。因为这不是一个师团与甲种师之间称谓的问题，还关乎到指挥权的归属问题，师团制可以受到国防军指挥中心与军团的双重指挥，但是更改为西方国家的甲种师乙种师。则受到军团管辖，总部没有权利直接指挥了。因此卢方的这条建议受到总参谋部的强烈反对。
师团和甲种师的区别，则是权力划分的一场较量，师团制自然对于总参谋部而言管辖权力更大，而甲种师制度对于军级管辖权更大，一场无声无息的权力斗争在国防军内部展开了。历来，关于权力之争都是非常残酷的，而提出意见的总军务部副部长卢方在这场权力之争中赢得了军团的人心，却失去了国防军司令部的人心，被认为是指挥中心的叛徒。
而王茂如内心之中也忽然对卢方失望起来，此时提出甲种师制度无意于将原本团结的国防军凿出一条裂纹来，师团制整改为甲种师将来势必会出现，但却不是现在，不是国家尚未统一之前。卢方这个原本极有可能将来接受军务部的未将将星，随后一直被司令部的军官们一致刻意压制着，直到他从军队退役军衔也没有改变。最终，原本支持卢方的军团长们，也很快感受到了指挥中心的意图，抛弃了卢方。卢方之所以失败有三点，第一点就是甲种师改制的提出不合时宜，第二点则是他太急于求上位，出卖了指挥部的权力，第三点是他在提出改革之前并没有与王茂如沟通得到王茂如的支持便冒然提出，还拉拢了大批军官。凭借着这三点，总参谋部甚至都可以弹劾与他，但最终在王茂如的干涉下，卢方仅仅被架空军衔不变而已。
随后陆军部军学司与国防军军校处合并，前海军军学司司长吴忠英，陆军军学司司长谢宝璋的安置问题倒成了个问题。经国防军指挥中心商议之后，建议吴忠英担任国防军海岸警卫队海军陆战队司令一职，建议