全国其他地区分成大大小小两百多个“藩”，藩的首领必须听命于将军。
全国的大名分为三类，亲藩、谱代和外样大名。
将军与大名都养着自己的家臣即武士，他们构成了幕府统治的基础。
从而形成了由幕府和藩构成的封建统治制度即幕藩体制。
在德川时代，全体居民都被严格的等级制度分为四个阶层：武士、农民、手工业者和商人。
德川幕府对外实行锁国政策，严禁日本人与外国贸易。
禁止日本与海外交往，把外国商人和传教士驱逐出境。
只许同大明、朝鲜、荷兰等国通商，而且只准在长崎一地进行。
琉球就变成萨摩藩和其他国家通商的重要口岸。
大明从他们手中夺取琉球，就断了他们经济来源和口粮。
想马上重新占领琉球，又担心打不过大明，那样会遭受更加严重损失。
于是他们决定刺杀大明皇帝，只有把朱由检干掉，大明就无暇顾及小小琉球。