包括之前派出赵樱空，也包括之前让复制体郑吒使用原暗宇宙终结几乎毁灭了整个东亚，虽然嘴上说着没有计划，但这一切似乎都在他们的计划之中。
碇真嗣已经近乎陷入崩溃之中，本来应该开始人类补完的，只要量产机到场，按照生命树阵图布置，理论上就能够完成人类补完，然而seele怂了，十三台量产机虽然强大，但每一台也不过是拥有接近四阶终极的实力，如果碰到现在的碇真嗣，都有可能被吊打，更不要说刚刚毁灭了整个东亚的存在了。
他们想不明白主神究竟是派来了怎样的怪物，才会对这颗星球造成如此恐怖的破坏，而在这样的破坏造成之后，主神派下来的轮回者的目的又究竟是什么？因此一时间根本不敢轻举妄动，明明有进行人类补完的机会，一时间却不敢出手。
而就在初号机进入神话形态，整台机体都漂浮了起来，连他身边的大地都开始失去重力，身边的废墟瓦力随着他的悬浮而一起悬浮起来的时候。
一直以来像是死机了一样的三号机，突然爬了起来，依靠着心灵之光，支撑着自己的身体，在对机体没有掌控能力的情况下，竟然爬了起来，像是提线木偶一样被心灵之光拖拽着，一跃而起，竟然一拳打在了神话形态的初号机的下巴上。
“你给我清醒过来啊！”心灵之光直接将声音传递到碇真嗣的心中，那正是他无比熟悉，也无比依赖的声音。
这声音顿时就打断了神话形态，碇真嗣也被打蒙了，头顶的光环就像是电流不稳定的灯泡一样闪烁明灭，人类补完的进程随时都可能终止。
“大叔？我……我不知道，我感觉我可以挽回一切，如果我想的话，如果进行人类补完的话，如果人造神明的话，一切……一切似乎都可以回归到灾难发生前的状态。”碇真嗣虽然还没有真正成为神一般的存在，但却已经隐约感觉到了那种强大的力量。
然而这话刚说出来，就被一阵噼头盖脸的数落：“是！你是无敌了，翅膀硬了就开始乱来了是吧？以为自己能向神明许愿就能简单粗暴的解决一切了是吧？
你都没搞清楚问题是什么，就要回到过去。回去干什么？回去让其他人陪你再死一次吗？
就算你可以向神明许愿，你能许愿什么？是回到过去还是要死掉的人全部复活过来，都没有搞清刚刚的爆炸是怎么回事，如果做完这一切之后，爆炸再一次发生的，那时候你又拿什么挽回一切？”
碇真嗣被骂的一愣一愣，头顶的光环也消失不见。硬生生的被一顿嘴炮给怼出了神话形态，随后有些不知所措的重新落回了地上，大叔出现之后，他似乎是又有了主心骨，下意识的就把决策的权利让了出去。
“那我现在应该怎么办？我……我们身边的人已经都死了，我们还能做些什么？”碇真嗣虽然退出了神话形态，但一时间却陷入了茫然之中。
“我们……带着剩余的幸存者撤离，去最近的澳大利亚基地，你们的机体都需要维修和整备。黑之月已经暴露出来，我们现在能做的就是把莉莉丝抗走，对了，还有把你爸抗走，总之需要找到一个防卫足够严密的地方，继续保护这些东西，不被剩下的使徒接触。
之前的爆炸应当，不是使徒造成的，如果有哪个使徒有这么强大的话，他应该早就突破了我们的防御，而和最终教条中的存在接触。
同样的，如果这是有使徒绕过了我们的防御，偷偷触发了第三次冲击，那破坏力也不会仅止于眼前这种程度。
如果是那种程度的爆炸，恐怕足以将整个世界都席卷，就算是你也不可能在这个过程中幸存下来。”
碇真嗣起初还有些迷茫，但很快就找到了接下来所需要做的事情，很快就找到了接下来行动的基调，一切都还没有结束，之前的爆炸不论是怎样的意外造成的，那都并不是第三次冲击，而地球上应当至少还存在着三个使徒，他们三个还没有前来对第三新东京市发动冲击。
而他们如果这个时候来袭，没有要塞都市的保护，单凭初号机和两台被重创了的机甲，是肯定没有办法保护最终教条的。
所以当务之急其实是将最终教条中的东西转移，送到最近的足够安全的基地保护起来，人类已经承受了重大的伤亡。但他们至少可以尽自己的全力避免更大伤亡的产生。
之前碇真嗣几乎崩溃有很大程度的原因就在于，他在那段时间已经不知道自己该做些什么了，就好像是在游戏中面临前所未有的失败，很多人都会不由的产生重头再新开一局的冲动，但很多时候如果仔细盘一盘自己的家底的话，其实就能够发现，就算是经历了前所未有的失败，这一切也比从头再来要好的多了。
初号机用自己的心灵之光，冲击唤醒了零号机和三号机，随后迅速找到了最终教条之中的白色巨大人形，即便是在之前的爆炸之中，莉莉丝也成功幸存了下来，三人都是能够初步使用心灵之光的存在，三号机将莉莉丝固定在自己的背上。
初号机则用心灵之光在自己的背上构建出来了类似机舱一样的存在，让总部之中还剩下的包括葛城美里和碇源堂在内的幸存者转