武士英知道事情已经败露，难以隐瞒，为免受皮肉痛苦，如实招供了暗杀宋教仁的经过，可悲的是，这个家伙直到这时还不知道杀的人是谁。以为只是帮应桂馨除掉对头，摆出了一副好汉做事好汉当的架势，直到巡捕们告诉他真相，他才恍然大悟，自己被人卖了。
经检验，应宅抄出地于弹，与宋教仁身上取出的完全相同。而应桂馨与洪述祖、赵秉钧地往来函电，也足以证实与袁世凯直接有关。这些电文几乎全都是双方密谋如何下手的电报。
洪述祖致应桂馨地函中，一再怂恿他“如此题目总以做一篇激烈文章，方有价值也。”
随着人民党、国民党大论战的深入。应致赵秉钧电：“人民党借章太炎之手。由日本购孙、黄、宋劣史（实为**）……用照铅印10万册，拟公开发行。孙、黄、宋、陈运动激烈，民党忽主宋任总理，忽又下手恫吓章太炎……”
3月18日，洪复应电：“寒电立即照办。”随即就命令武士英下手。次日凌晨2时，武士英刺杀末教仁后不到4小时，应便立刻致洪述祖电：“匪魁已灭，我军无一伤亡，望转呈。”
随即，洪述祖致应函：“两电悉。不再另复。我将于4月7日到沪。520”
至此，人证物证俱全、杀害宋教仁的主谋，正是袁世凯，同谋犯是赵秉钧和洪述祖，具体策划是应桂馨，凶手是武土英。应桂馨、武士英二犯落网后，袁世凯惶恐万状。3月29日。他密电程德全说：“连接南方私人来电。宋案牵涉洪述祖，是否确实。究何情节，宜速查复，以为凭核。”接着，他又电催程德全报告“证据”，以谋对付办法。他的机要秘书也多次密电程德全，要他把牵涉中央的证据向英厅索取，派人送京，并特别叮嘱说：“可不作正式报告。”
此时袁世凯方寸大乱，他忘记了，他还根本不能完全控制江苏和上海一带，有的人布置和经营比他更深--秦时竹。
宋案发生后，以张謇为代表地人民党南方局，陷入了短暂地迷茫，他们不确实到底是不是秦时竹干地。报界舆论铺天盖地，对他们的压力也不小，南方高层频频密电，一方面询问、追究到底是否秦时竹下令，另一方面也在探讨究竟如何应对。秦时竹坚决否定了任何猜忌谣言，但对于辟谣又认为不重要“终究还是要靠事实说话……”
他们想要地事实终于来了，如此大好的机会不加以利用，岂非可惜？在涉及的相关电文透露之前，程德全、张謇等人已通过报纸放出风声，狠狠批驳国民党和袁世凯政府的诬蔑，一时间矛头转向，上海滩好不热闹！
事实证明了秦时竹的事前预计，当真相大白之时，民众固然同情、痛惜国民党，但对于丝毫没有参与的人民党更具好感，特别是人民党在遭受如此诬蔑之际，犹然坚持原则，对比《民立报》等大肆造谣、鼓噪党派矛盾，认为是好了很多。先抑后扬、后发制人地大智慧轻轻一个变向，便将泼向自己身上地污水全部返还给了对手。
案情接近真相大白后，如何应对成为了北疆高层心目中的大事，秦时竹立即召开军事会议，准备统一思想，部署应变，来出席的都是各部主官。
首先通报中、俄谈判的好消息，经过卓有成效的努力和大量的烟幕弹，俄国方面首先承认了外蒙主权归属中国所有、俄国没有领土要求的事实，作为让步，中国方面承认俄国在外蒙有特殊利益，答应将恰克图-库仑铁路的借款优先权让渡给俄国，并表态将来愿意和与西伯利亚大铁路相连接；其次，俄国同意在调停代表团的监督下，不再向中国境内派遣部队，原有驻扎部队一律停留在营地，中国方面做出的让步是撤销哈尔滨之围，并承认不攻打俄军任何营地，在此之前，中方还必须在国际红十字会地监督下，向俄国移交全部伤员。
列强插手和谈得到的好处也是比较明显的，库仑到张家口的借款进行了协议草签，由六国组成联合借款团，共同向中国借款400万英镑，九四折扣，年息7厘，由于该项协议并不以路权和矿产作为抵押，中国方面同意由银行团组成一个联合监管委员会，由中方建设公司每月向其报告资金使用情况。
会谈进入了第二个阶段，也是更加棘手的阶段--双方的战争赔款问题，战争责任问题和俄国驻军问题。
秦时竹首先致开场白：“中、俄谈判，取得重大成果，虽然还没有达成最后协议，但距离和解已越来越近了。俄国承认了我们的外蒙主权，并答应不再增兵，这都是有利地，我军也已解了哈尔滨之围。”
张绍曾笑了：“其实后面两项对我们也是有利无害，包围哈尔滨一方面耗费了大量物资、金钱，另一面也使得部队处以高度地紧张状况，解围后，我军正好可以趁势休息；至于交换伤员，也非常好，这些俄国伤员，每天都要消耗我们宝贵的资源和人力，正好把包袱甩给俄国。”
“作战中负伤、阵亡将士地抚恤金已经发下去了，对有功人员的褒奖也正在陆陆续续进行……”蒋方震汇报道，“