空军政治部主任：谢瓒安少将
空军装备部主任：冯如中将（兼）
空军后勤部主任：郑明涛准将
空军学院，直属空军司令部，主要承担飞行员培养任务，下辖5个航空队，分为战斗、攻击、轰炸、侦察与运输（运输主要针对伞兵），一般要求飞行员掌握两个科目，考虑到科目属性，大多数情况下都是战斗/侦察，攻击/侦察，轰炸/运输三类。海军航空兵同样在空军学院受训，但在空军学院毕业后，还需要到葫芦岛基地接受1年左右的上舰训练，而一般飞行学院分配到联队后只要半年就可以正式入编，因此海军航空兵的选拔标准更为苛刻一些。从军衔上也可以看出来，陆军飞行员起步军衔是少尉，而海军飞行员起步军衔是中尉。按照小队、中队、大队、联队的编制，上尉担任小队长，少校担任中队长，上校担任大队长，联队长就是准将了（从国防第二期整编计划开始，国防军取消全部代将军衔，一律称呼为准将，陆军授予旅级正职，海军授予主力舰舰长、海军航空队总队长、海军陆战队总队长，空军授予联队长）
院长：秦国镛中将
副院长：余焜和少将
教育总监：李宝浚少将
技术总监：谭根少将（兼）
第一航空研究所（简称一航所），重点研究战斗机、攻击机、侦察机等，驻地南苑
所长：冯如中将
副所长：巴玉藻上校
工程处处长：曾贻经中校
第二航空研究所（简称二航所），重点研究轰炸机、运输机、水上飞机等，驻地秦皇岛
所长：谭根少将
副所长：王助中校
工程处处长：王孝丰少校
同时，飞行器制造正式从辽阳体系中剥离出来，成立了中国航空工业制造总公司（简称国航公司），驻地包头，临近中国装甲工业制造总公司，承担全部定型飞机的制造工作。事实上，在早期的航空器研制中，航空发动机与装甲发动机在很多时候是可以通用的。
何峰最后说道：“这个编制其他都不令人担心，唯一有点麻烦的是如何处理海军航空兵与陆军航空兵之间的关系。从飞机的生产、制造、训练、使用来看，海陆具有高度的通用性，从作战来看，海军航空兵应该直属于海军管理更为方便。更麻烦的是，空军脱离总装管辖后，军费独立，就海军航空兵这个领域如何切割与海军的关系，也是一个难题。”
这个话一出口，萨镇冰就急了：“大总统、陆总长、何主任，我们海军认为，海军航空兵最好仿效海军陆战队的管理办法，由海军进行统一管理，形成海军三位一体的打击力量，至于军费什么的，当然好商量。不仅空军学院培养飞行员海军会掏钱，航空研究所、国航公司的研发制造海军同样承担费用。我们唯一的要求便是，海军飞行员的要求更高一些，希望毕业时能由海军先挑。”
秦时竹大笑：“萨老的算盘好精啊，其他我原则上都同意了，唯独这最后一条先挑的要求太过于掐尖了，恐怕空军会找你拼命的。还得琢磨一个两全其美的办法，各位提提意见。”