赵子玉回国引起的注意力转移，让蒙疆很多大事都被掩盖了，头一件，就是蒙疆军队的大调整，四大军区和陆海空三军正式建立，为掩人耳目，对外并不公布，陈振林也以副总司令的身份，掩盖了其海军总司令的真实身份。，.
相比陆军，空军的设置容易些，孙仲华出任了蒙疆军事委员会空军部司令，杨相林为副司令，高志航则进入参谋部出任空军总参谋长，而空军的日益强大，也促使空军体系的初步形成，在空军司令部下，设有三个航空军，第一航空军驻地辽阳，由杨相林兼任军司令官，下辖第一战斗机联队，四个大队的飞鹰5战机，丁纪徐出任联队长，第二战斗机联队，四个大队的飞鹰2，岑泽鎏出任联队长，第一轰炸机联队，三个大队的解放者轰炸机，一个大队的天火轻轰炸机，由李学炎出任联队长。
第一航空军下还有林峰的第一战术联队，有四个大队的天火2对地攻击机，驻守济州岛的第三战斗机联队，一个大队的飞鹰5战机和三个大队的飞鹰2，联队长邓从凯。
第二航空军驻守张垣，军司令官徐焕生，下辖第四战斗机联队，四个大队的飞鹰2战机，联队长黄光汉，第二轰炸机联队，两个大队的解放者轰炸机，两个大队的天火轻轰炸机，联队长王育根。
第三航空军驻守光明城，阎海文为军司令官，下辖第五战斗机联队，四个大队的飞鹰2战斗机，联队长李向阳，第三轰炸机联队，三个天火轰炸机大队，一个解放者轰炸机大队，联队长蔡振东。
除了三个航空军外，空军下属共有宝昌司令部及训练基地，以及赛尔乌苏训练基地，尚有一个大队的飞鹰5和十个大队作战训练用的飞鹰2，宝昌以外，有佐世保、济州岛、辽阳、延吉、张北、光明城、库伦、太原和张垣九个空军基地，除各航空军联队、大队驻守外，还有九个直属飞鹰2大队，作为基地常驻防卫力量。
总数算下来，蒙疆空军拥有飞鹰2战机一千二百多架，飞鹰5一百八十架，天火轻轰炸机三百二十多架，天火2对地攻击机二百一十多架，解放者远程轰炸机三百二十多架，其余侦察机、教练机六十多架，共有两千三百多架各式战机，这还未包括库存。
海军则是新设，陈振林出任海军部司令，副司令则由正从澳大利亚返回蒙疆的苏斌出任，卫立煌如愿以偿，成为参谋部海军总参谋长。
陆军的调整就比较大了，傅作义出任陆军部司令，特木得为副司令，在和延安沟通，考虑双方一些实际问题后，左权出任陆军总参谋长的方案放弃了，由张煜出任陆军总参谋长。
四大军区的设立，意味着蒙疆各兵团的分拆，考虑到现在的实际情况，张自忠出任海外军区司令，高桂滋为副，牟中衍为参谋长，登陆日本的第三兵团十五、十六、十七、十九师和早先日本战区登陆的第六师、十八师、二十九师、一零一坦克师、四十四师，共计九个师组成海外军区，其余第十、十二、二十师则划归东北军区，等战争结束后返回东北，一零五师、蒙疆近卫师归属联合政务委员会。
吴克仁出任东北军区司令，冯钦哉为副，李建波为参谋长，东北军区下辖原第二兵团十一、十四师、三十一师，加上现在还在日本，准备划入的第十、十二、二十，已有六个师，考虑要应对今后苏联在这一线可能的威胁，原机动兵团一零三、一零四师划入，在加上第四兵团在朝鲜的二十一、二十二、二十三、二十四师，东北军区拥有十二个师，冯钦哉在朝鲜指挥作战。
叶启杰出任北方军区司令，布塔其?朝克为副，札木斯朗?云登为参谋长，原库伦军区取消，下辖原第一兵团第七、第八、第九师和库伦军区的第五、四十、四十一、四十二、四十三师，调入一零二、一零六装甲师，共计十个师。
沈忠毅出任南方军区司令，孙震为副，孙连仲为参谋长，下辖原第五兵团二十五、二十六、二十七、二十八、三十师，加上第六兵团三十三、三十四、三十五、三十六、三十七师，也为十个师。
组建近卫集团军，那木海扎布出任司令，何柱国为副，刘宝章为参谋长，下辖三十二师、蒙疆近卫师、一零七师和一零五空降师，该集团军依然隶属蒙疆联合政务委员会，可以说是方、陈、傅等人为赵子赟打造的近卫军。
和以前各兵团相比，有一个明显的变化，那就是机动兵团取消之后，原机动炮兵部队进行了重新设置，更换新自行火炮的机动炮兵团不再独立存在，而是直接配属到师，以一零五榴弹炮为主。
军区设定之后，在军区下设置了独立炮兵团，分为自行火炮炮兵团和牵引炮兵团，自行火炮炮兵团用于战时临时配属给师使用，主要装备一五五榴弹炮和火箭炮。牵引炮兵团一般不配属给师一级作战，而是作为防御力量，用于战略要地的防守，以一五五榴弹炮为主。
炮兵如此设置，是考虑到自行火炮机动力强，但持续能力弱的特点，重新布置牵引火炮，主要还是考虑到以后防御将是一个重要的课题，牵引火炮配属弹药车，机动力是差了，但火力能够持续保证。就目前四大军区，东北军区和南部军区是重点，拥有总数超过二十个的牵引炮兵团，共有一五五榴弹炮四百八十门，一零五榴弹炮三百六十门，分别驻守在太原、张恒、山海关、安东、延吉等地。
这份名