毛主席接着说，如果国民党继续这样搞下去，就是抗日统一战线全面破裂的开始，我们必须做好准备。要挽救时局，实现局面好转，必须要求蒋介石取消十七日国民党的谈话，不取消这种文件，我们决不能与蒋介石及他的军事委员会有公文来往。自蒋介石十七日发表公开破裂文件后，表示蒋首先破裂，因此一切同情与理由都在我们方面，这样来看，这次皖南失败的代价是值得的。
据此，毛泽东当天致电周恩来、刘少奇等称：“蒋介石已将我们推到和他完全对立的地位，一切已无话可说。”“现在这样的国共关系，已对我们、对革命没有任何利益，并且破裂是蒋发动的，对我们甚为有利。中央书记处并再度要求周恩来、叶剑英、董必武、邓颖超及新四军、八路军在各地的办事处、我党所办报馆等重要干部于最短期间离开重庆，转移到我党控制的地区。
又经过几天的慎密观察，中共中央于23日再度召集政治局会议，毛泽东主席进一步得出结论称：一周以来的种种事实都证实，中日实际上已经休战，不议而和，全国破裂已经开始。我党与蒋介石的合作已经没有好处，对我不仅没有好处，对蒋因日本停止进攻，也没有好处，因此这种合作已无存在之可能。
如果日军与国民党反共军配合，那我党有很大危险，将会受到损失。在当天给刘少奇的电报中，毛泽东更清楚地说明了他对事变性质和后果的看法。他认为蒋介石一月十七日命令是全国性突然事变的开始，是全面投降与全面破裂的开始，我们在十二月十七日以前的估计不适用了。
莫斯科对皖南事变的发生，亦深感不安。尽管国民党方面及时地通知了苏联大使，皖南事变仅为地方性事件，不会影响到国共两党关系，但据蒋介石在1月17日国民党军委会发言宣布新四军为叛逆，并取消其番号之后，苏联驻华军事总顾问、驻华大使，就频频造访，对国民党的做法提出种种批评，弄得蒋介石不胜其烦。
而且在中国访问的苏联外交人民委员（外交部长）更以拒绝出席国民政府驻苏大使宴会的方式，显示了苏方的强烈不满。
据周恩来副主席报告称，苏联驻华武官兼军事总顾问，后来的苏联元帅崔可夫刚一得到事变发生的消息，就秘密会见了周恩来和叶剑英，提议：皖南新四军主力应坚持北上，另在江南地区视情况约留一小部干部和武装，埋伏在民间。如国民党质问时，可作为此次被包围攻击后的散兵。”“到江北后国民党将继续迫你们北上，那时可以答复他，鉴于皖南事件，如要继续北上，必须先将江苏境内国军全数离开江苏，应求得安全北上的保障。这样仍能拖延。考虑到国共内战可能爆发，他特地请中共中央“迅速调查兰州到延安间各种情况（道路、碉堡、驻军、民众、粮食等），包括西北五马及傅作义部的情况，以备万一援助之需。并称：如果国民党如继续内战，我崔可夫有权暂时停止苏联援华军火于新疆哈密的途中。