且不提杨清风被原子弹的强烈风暴炸得全身化为焦碳，生死难料，但说爱丽丝那边，情况也不容乐观。
爱丽丝等人乘直升机逃离小村之后，飞了不过二十分钟，便遭到三架直升机的追击，这次保护伞公司是真的下了血本。
爱丽丝等人所乘的虽然是装甲直升机，可以抵挡子弹和机关炮，但却无法抵挡飞弹，还好那两名司机驾驶技术错，开着飞机与其周旋，躲过了数枚飞弹，但最终还是被一枚飞弹击中飞机尾部，飞机坠落在一片森林之中，所幸没有爆炸。
爱丽丝又被保护伞公司给生擒了，带回了底津特的基地做起了实验，当实验完成之后，爱丽丝的能力增一步强化。
所幸的是爱丽丝最终还是再一次逃了出来，卡洛斯与吉尔安吉拉等人还是被放出，众人一路逃离保护伞公司基地，但还是被保护伞公司以卫星定位。
爱丽丝不得不与卡洛斯等人分离，一路东躲西藏，躲避着保护伞公司的追捕。
而自那次两颗核弹的事件曝光之后，举世震惊，保护伞公司受到社会的强烈遣责，并受到了联邦政府的制裁，过不了几月，终于破产，但保护伞公司并未因此而停止对生化病毒的实验，反而越加猖狂。
她们拿爱丽丝的细胞做实验，克隆了许多个一模一样的她，每一个都有不俗的能力，不仅如此，他们还拿丧尸做实验，企图驯化它们。
保护伞公司虽然对生化病毒早有研究，但他们显然还是低估了生化病毒的传染能力，他们以为原子弹可以将整个浣熊市的生化危机完全终结，他们以为自己可以控制事态。然而，事实是，他们错的离谱。
几个星期之后，浣熊市附近开始出现感染的生物，它们拥有极强的攻击性与生命力，传染速度惊人，如此才过了不过几天，感染便开始向浣熊市四周漫延，再过了几周，感染漫延至整个联邦。遍地开花，丧尸不处不在。
到了现在这个阶段，哪怕是用核弹对整个联邦进行地毯式清洗，只怕也已无用，事态一发不可收拾。
这样再过了一段时间，感染终于从联邦感染至全球，地球变为了不毛之地，大多数城市被丧尸所占领。
这些丧尸们只要闻到人类的气味便会蜂拥而至，人类幸存者们根本不敢在同一个地方呆上太久。更不敢进入城市中心，不得不东躲西藏与丧尸们展开了长期的持久游击战。
所幸的是，大多数丧尸行动缓慢，战斗力低下。数量虽众，但幸存者们只要摸清楚它们的习性，对付起来也不算太难。
干净的食物和水源成为了幸存者们极为严重的问题，幸存者们不得不到处寻找食物和水。连保护伞公司内部，都已经发生食物危机，不得不降低食物配给。
这个世界的人类。现在正在处于灭亡的边缘，连大多数的动物都已经感染而成为丧尸，植物大多枯死，原先美丽的草原，森林，变成了荒漠，这星球仿佛成为一颗死星，希望仿佛已经不在，人类们正在做最后的挣扎，
谁也不知道自己能活多久，谁也不知道自己哪一天会成为丧尸的食物，谁也不知道自己哪一天会成为它们的同类，并最终因食物缺少而化为一摊恶心的烂肉。
联邦的幸存者们零零散散地建立了一些难民营，并组建了护卫队来与丧尸做战，保护难民营的安全，此时，幸存的人类基本上已经是全民皆兵，可惜的是枪支弹药是很大的问题。
还有许多幸存者成立了自己的车队，他们以车为家，整天就坐在车里，东奔西跑，游战于城市与荒漠之间，一边与丧尸做战，一边寻找安全的地方，同时，一边寻找食物水还有武器。
查理.瑞福德车队便是这其中的一支，他们有大小车辆五六辆，幸存者数十名，他们组成了这个临时的家，他们改装了车辆，加强了车辆的装甲，杀起丧尸来，自然是更加得心应手，既便是有大队丧尸阻路，开着改装的大卡车往前一冲，一片丧尸也能撞个稀烂，冲出一条生命。
克莱尔.雷德菲尔德便是这支车队的首领，她虽然年轻，但性格坚毅，而且非常英勇，甚得车队成员拥戴。
卡洛斯.奥利维拉也是这个车队的主要成员之一，他身手不凡，战斗力很强，是这个车队的骨干成员。
除他之外，安吉拉与阿西福德博也在这车队之中，自数月前众人与爱丽丝分离之后，保护伞公司一直将精力放在了爱丽丝身上，这几人的份量，在保护伞公司眼里，自是不能与爱丽丝相提并论。
是以他们倒是逃得一命，因为有阿西福德博士这个专家在，车队幸存者的感染情况倒是好了许多。
只可惜的是，食物和水还有枪支弹药对他们而言，一直是一个最大的难题，他们不得不经常冒着生命危机深入小镇和小村中寻找食物。
不断的有新的幸存者加入，也不断有新的幸存者死去，这样的日子，过了数年。
这一日，车队行至沙漠之舟汽车旅店，车队停在百余米开外，克莱儿立即令一个名叫米奇的青年广播，并寻找幸存者。
卡洛斯则站于车顶以望远镜观望，广播叫了两三遍，也无人应答，此处安静之极，似已不存在活人，卡洛斯立即带领一名黑人向里搜寻。
进入旅店，竟有几只丧尸隐藏于此，黑人不幸被丧尸咬了一口，卡洛斯击毙了丧尸，将这店内丧尸清理一空，众人放才敢靠近旅店，并进入里面搜寻食物