数日之后，第一批战兵到来。
让玉明震略感意外的是，杨屹首先让克隆战士接受改造。虽然都是人类，但是玉明震没把这些克隆人当成同胞。对杨屹做的安排，玉明震不敢说三道四，只能相信让克隆战士首先接受改造，只是因为杨屹还没有完全掌握相关技术，存在很大的风险，所以先拿克隆战士做实验。
玉明震没有猜错，不过也不是全对。
不是说杨屹没有把克隆战士当回事，毕竟人类远征军中就有克隆战士，而且始终跟随杨屹左右，立下了汗马功劳，也证明了他们配得上人类的身份。主要是，改造涉及到了意识层面上的问题，而克隆战士较为单纯，因此更有把握应付改造时产生的影响，而人类战士显然做不到。
第一批接受改造的克隆战士只有一千名，不算很多。不是说杨屹不想改造更多的克隆战士，而是暂时做不到，即在这几天之内，他只弄出了一千套改造设备，一次只能对一千名克隆战士进行改造。
所谓的改造设备，其实跟飞船上的那套设备差不多。
飞船来之能源模块，因此飞船上的所有物品都来自能源模块。在获取了能源模块里的信息之后，哪怕掌握得并不是很全面，了解也不够彻底，但是足够杨屹制造用来进行改造的设备。如果说要有什么问题的话，就是这些设备太复杂，就算杨屹不休不眠，其实他也不用休息，在短短几天之内也只弄出了一千台。
所幸的是，改造过程并不复杂。
在北阿尔法星系，杨屹已经让杨二对林凤等多名战士做了改造，而且全程旁观。虽然没有直接参与改造工作，但是杨屹对改造的过程一清二楚，也知道该重视什么，因此在改造克隆战士的时候是轻车熟路。
理论上，利用来自能源模块的技术，杨屹还能对自身进行改造，也就是让自己成为傀儡级别的存在。
只不过，现实中根本办不到。
不是说没有这样的技术，而是没有这样的能力。
所谓的改造，其实也跟傀儡有关。
能源模块本身就跟傀儡存在密切关联，可以说是傀儡的根本所在。在能源模块里面，存在大量跟傀儡有关的信息，比如傀儡的基本形态。杨屹对克隆战士所做的改造，其实就是利用了这些信息，为克隆战士打造一具全新的躯体，让克隆战士获得了远远超过普通生命的强大实力。只要能够充分利用这些信息，杨屹完全有能力打造出一具傀儡的躯体，也就能获得傀儡的实力。问题是，杨屹还没有获得全部信息，而且改造涉及到更深的层面，对改造过程中的控制要求非常高。能做到的只有一个人，即杨二，可是他没跟随杨屹回来，也就无法帮助杨屹完成改造。更重要的是，就算杨屹获得了全部信息，也无法在接受改造的同时控制改造过程。
当然，对克隆战士进行的改造不需要杨屹亲自动手。
在这几天里，他不但制造了一千台改造设备，还对玉明震提供的一个智能程序做了一些改动。
这个智能程序，其实也是杨屹的“熟人”，即“暗影”号上的阿伦。
虽然“暗影”号早已在战争中损毁，但是阿伦的基础程序保存了下来，只是因为没有合适的战舰，所以一直储存在军部的数据库里。杨屹所做的，也只是让阿伦具备基本的情感因素。虽然远远无法跟杨二相比，但是控制一千台改造设备，对一千名克隆战士进行改造，显然难不倒阿伦。
事实上，像阿伦这样的智能程序，最大的价值就是代替人类做一些繁杂的工作。这些智能程序能够控制最大的战舰，而主力舰上有成千上万的设备，还需要及时处理众多信息，相对而言，一千台改造设备根本不算多，而且所有克隆战士的改造工作同时进行，因此处理的信息也不算复杂。
做好一切安排之后，杨屹就把改造工作交给了阿伦。
当然，他也没闲着。在对一千名克隆战士进行改造的同时，杨屹动手制造了更多的改造设备。如果需要对两千万名战士进行改造，那么别说是一千台，就算是十万台，甚至一百万台改造设备也不够。虽然没有把握制造足够多的改造设备，但是这个时候，杨屹也只能走一步看一步了。
十日后，第一批克隆战士的改造工作完成。
他们原本就是战兵，而且获得了由杨屹提供的圣器，所以在完成改造之后，他们并不需要花多少时间进行训练。唯一要做的，只是熟悉玉家制造的皇级战机，因为只有驾驶皇级战机，这些完成了改造的克隆战士才能跟那些拥有座架的战皇匹敌。很明显，硅魅联盟的战皇来到南阿尔法星系，其中一些肯定有座驾，而且肯定是十二级以上的硅兽，也许还是凶猛的野生硅兽。就算并不是所有战皇都有，但是只要有一名战皇拥有座驾，那么与之遭遇的人类战士就需要皇级战机。
当然，玉家的皇级战机生产线一直在全速运转，提供一千架皇级战机不是什么难事。随着极境族提供的支持逐渐发挥作用，皇级战机的产量也得到了提升。用玉明震的话来说，基本上能够满足武装人类战士的需求。等到航线打通，跟极境族取得联系，还能获得由极境族制造的皇级战机。
一切准备就绪之后，杨屹给这些克隆战士安排了任务。
他们的使命不是去收复那些被战皇攻占的恒星系，也不是去找战皇决战，而是去搞清楚各个恒星系的情况