沐起元让刘飞宇解放汉人奴隶，驻守在察隅，接应后续的补给队伍，自引十九军经过墨脱，指工布（今林芝）。
一路上见到的零星藏人，都被明军杀尽了，但十九军却没见到什么城堡。
先锋刘臻羽很奇怪，藏人与游牧民族不同，他们已经进入农耕时代，怎么会没有城堡呢？
他不知道，乌斯藏作为政教合一的地方政权，刚刚经历过一系列的动荡与战乱，但这些战乱与汉人无关，而是乌斯藏复杂的宗教流派与地方政权的一次重新洗牌。
佛教自传入乌斯藏以来，对藏人的影响非常之大，藏人几乎全民信教，只是教派不同。
藏传佛教在乌斯藏的土地上，主要有四大流派：
一、宁玛派，俗称红教。
宁玛派立教最早，大约在北宋初年达到鼎盛，后来逐渐衰微，到大明崇祯年间，只有位于贡噶县雅鲁藏布江北岸山脚的名吉扎寺的存在，勉强维持着宁玛派，对乌斯藏的地方教派与政权，已经没有什么影响了。
二、萨迦派，俗称花教。
由昆氏家族于北宋年间创立，萨迦派的法王也都是昆氏家族的人，一直以日喀则附近为其主要势力范围，寺庙几乎遍布乌斯藏与朵甘，祖寺是萨迦城内的萨迦寺，位于日喀则西南。
大明成祖年间，曾经赐封教中高僧衮噶扎西为“大乘法王”，地位仅次于白教的“大宝法王”；还曾赐封另一高僧南喀需必坚赞为“辅教王”，有世袭的领地，由此可见花教在乌斯藏的影响之大。
三、噶举派，俗称白教。
白教内部也有许多流派，但教义相似，传入乌斯藏之前就是同源，因此内部冲突不大，以拉萨西北的粗卜寺作为祖寺，主要势力范围在拉萨、工布及朵甘的玉树一带，大明永乐三年（公元1405年），成祖赐封粗卜寺主为“大宝法王”，是当时地位最高的全藏法王，在所有的藏人区都有寺庙。
噶举派首创了活佛转世制度，可见白教在乌斯藏的超然地位。
四、格鲁派，俗称黄教。
由宗喀巴于大明永乐七年（公元1409年）创立，虽然立教最晚，但影响却是最大，格鲁派一出现，就立即传遍藏人区，迅速在藏人心目中最为重要的前后藏居于统治地位。
格鲁派有六大名寺，其中在乌斯藏的就有位于拉萨的三大寺和位于日喀则的扎什伦布寺。
拉萨的三大寺包括甘丹寺、哲蚌寺和色拉寺。
甘丹寺位于拉萨城东北的卓旦沃切山，由格鲁派创始人宗喀巴所建，是格鲁派的祖寺，寺中主持称“甘丹赤巴”，是唯一由选举而不是转世而来的，地位仅次于达#赖与班禅。
哲蚌寺位于拉萨城西部的格培乌孜山，格鲁派最有影响的达#赖就是在这里修行，寺主称“哲蚌赤巴”，一般由达#赖所兼任，著名的布达拉宫就位于哲蚌寺。
色拉寺位于拉萨城北郊的色拉乌孜山，寺主称“色拉赤巴”，有时也是由达#赖兼任，色拉寺是培养武僧的基地，进入中原地区的佛教黄派武林高手，多半出自色拉寺。
而扎什伦布寺位于日喀则西郊，是班禅的修行地，当然此时还没有班禅的封号，“班禅”是大清顺治二年（公元1645年）由顺治赐封的。
但扎什伦布寺的寺主地位极高，甚至高于甘丹寺的甘丹赤巴，每逢达#赖去世后，寻找转世灵童、处理政务工作时，他都临时主政，地位可见一斑。
但由于日喀则地区人口远远少于拉萨，经济收入不如拉萨地区的寺庙，所以班禅在黄教中地位屈居达#赖之后。
让人觉得不可思议的是，四大教派虽然各有自己的传统领地，但都在整个藏人区广建寺庙，因此，格流派的寺庙往往混杂在一起，给各流派的纷争埋下种子。
乌斯藏是大明土地上少有的政教合一的地区，其宗教纠纷也与地方政权有着千丝万缕的联系。
从蒙元开始，统治乌斯藏的首领是来自山南地区桑日县的帕木竹家族，首领被赐封为“大司徒”，大明建国后，洪武帝赐封为“兰花王”。
后来政权被当地的朗氏家族继承，以乃东县为统治中心，主要活动在前藏地区，也就是拉萨。
随着帕木竹政权逐渐腐败，各地方首脑渐渐建立自己的势力范围，成尾大不掉之势，这些地方首脑的职务，沦为终身制，后来又称为世袭制。
后来，帕木竹政权的外戚格氏家族逐渐取得对地方的控制，建立了以日喀则为中心的实质上的政权，藏人称之为“仁布巴”，大明朝廷也予以认可，嘉庆四十二年（公元1563年），仁布巴的家臣辛厦巴才旦起兵反叛，辛厦巴家族控制了乌斯藏地方政权，首领称“第斯藏巴汗”。
大明万历四十年（公元1613年），继任者彭措南嘉控制了阿里地区，这一地区的许多小国都被占领，除古格王朝外，整个乌斯藏基本上为辛夏巴家族所控制。
但辛厦巴家族崇尚噶举派（白教），极端仇视格鲁派（黄教），仇视格鲁派给藏传佛教带来的革命性大洗牌，因此，常常武力威胁格鲁派。
大明万历四十五年（公元1618年），彭措南嘉武力占领色拉寺和哲蚌寺，屠杀、驱赶寺中格鲁派僧人，破坏庙宇、建筑，并随后正式建立以日喀则为中心的乌斯藏地方政权，成为继帕木竹巴、仁布巴之后又一世俗的乌斯藏贵族政权，彭措南嘉自称藏巴汗。
大明天启元年（公元1621年）