了解完秦兵的状况后，李定国和李来亨又简要介绍了敌人的情况。原来这两员大将都是有心人，看出朱由检对作战计划很动心后，就各自提前派出侦察兵，冒充走私的商人，到包克图做了一番侦察。两方的情况互相印证，就可大略掌握蒙古人的兵力分布了。
原来鄂尔多斯部内部又分为六旗，每旗约有两千户，共约一万余户；每户的青壮年男子少则一人，多则三四人。蒙古人是“马背上的民族”，每个成年男子都是战士，因此共有二万左右骑兵，剩下的就是老弱妇孺了。其中他们的酋长帖木尔自辖达拉特旗，号称“青山汗”，就在包克图一带游牧。其余五旗则以包克图为中心，或近或远地分布着。
说起来，鄂尔多斯部的兵力与秦兵也不相上下。但自从隆庆年间“俺答封贡”后，西北边境相对较为稳定，鄂尔多斯部已经数十年没经历过大的战争，族人较为懒散，整日沉迷于美酒妇人，战斗力大打折扣。
不过现在已经入秋，随着天气转凉，蒙古草原上的其他部落会逐渐向南迁徙。这些部落尽管平时为争夺草场，偶尔也会有冲突，但面对汉人，总是一致对外。如果等到那些部落赶到河套地区，那可就比较麻烦了。
了解了所有相关情况后，朱由检终于下定决心，事不宜迟，立即展开复套作战。在他看来，不管是哪个部落，总归都是蒙古人；只要是蒙古人，就是大明、也是他朱由检的仇敌。此番复套作战，不但是为了收复失地，为千千万万被蒙古人残杀的汉人百姓报仇，也是为了告慰李崇瑶的在天之灵！
复套作战计划基本采取李定国的方案。整个行动分为三个阶段。第一阶段是以少量兵力突袭包克图，将长期在那里设集市做生意的蒙古人全部歼灭，并迅速建立防御工事；第二阶段是用这少量兵力吸引鄂尔多斯部的大部兵力来围攻，并且死死地拖住他们；第三阶段则是以主力骑兵部队对敌军进行反包围，里应外合一举歼灭之。
这个作战计划虽然构想巧妙，但实施起来难度也很大，每个阶段都面临不同的困难，而最困难也是最关键的就是第二阶段。其难度在于，在这个阶段不能投入兵力太多，否则以蒙古人的狡猾程度，很可能会放弃包克图北遁入茫茫草原，那就无法实现全部落歼灭的作战意图。
但兵力太少，又有被敌人一口吃掉的危险。尤其是包克图地势平坦，无险可守，当蒙古人的上万大军发起冲锋时，如果与之硬拼，即使是秦兵的主力部队也难有胜算。
因此在这种情况下，以配备火器的步兵和车兵为主，构筑临时工事，用阵地战抵御蒙古人，使敌人失去骑兵的传统优势，就成了朱由检惟一的选择。在这方面，第一团无疑沾了很大的光，他们不但火器装备最好，新加入秦兵的五百戚家军也暂时划归一团，那数十辆战车和几十门小型佛朗机炮可是阵地战的利器。
因此在经过反复讨论之后，朱由检做出决定：以解胜的第一团两个步兵营、一个车兵营、一个工兵营、外加五百戚家军，和李定国的第二团一个步兵营、一个车兵营，共约三千兵力，承担第一阶段和第二阶段作战任务。
而四个团的所有骑兵营、侦察营共约五千兵力，隐匿在包克图以南的沙漠中，负责决定性的第三阶段作战。解勇的第五团则抽出骑兵和侦察兵做为预备队，一旦战事不利，负责接应主力撤出战斗。
由于兵力一分为二，在谁担任战场最高指挥官的问题上，又发生了激烈的争执。朱由检本来打算亲临包克图指挥作战，但所有将领一致坚决反对，理由是战场太过危险，尤其是还要故意被围困一段时间，秦王一旦有个闪失，那一切都失去意义了。
朱由检拗不过众将，也只得退而求其次，跟随骑兵部队参加第三阶段的战斗。这回谁再拦也不管用了，如此重大艰险的作战，朱由检不可能缩在大后方。这个时代又没有电报电话，根本无法遥控，朱由检做为全军主帅，必须亲临一线掌握敌情。而且他对整个部队的士气激励作用，也是任何人无法代替的。
接下来郝永忠和李来亨又想抢着去参加第一阶段和第二阶段的作战。因为他们心里很清楚，相对于图穷匕现的第三阶段，被敌军重重包围的第二阶段更为危险。这么艰巨的任务，他们可不想推给战友，都想把指挥权抢过来，自己去面对蒙古人的疯狂进攻。
朱由检却把脸一沉道：“本王已经做出了决定，你们就不要再争了。第一团和第二团对火器和车战运用更为娴熟，而第三团和第四团骑兵有优势，本王这也是量才而用。前两阶段，由李定国负总责；第三阶段，本王亲自指挥！兵贵神速，本王给你们三天时间返回驻地动员部队，三天之后必须出发，先到李来亨的鄜州集结。但是不可提前透露行动计划，只说是正常训练。从出发到集结完毕，大概需要五天；鄜州距包克图八百余里，又途经沙漠地区，步兵和战车至少也需要十天时间。今天是七月初八，我们要争取在月底之前结束战斗！”
令出如山，除了解胜之外，其他四员大将当夜就离开了秦王庄。解胜的第一团立即开始紧锣密鼓的备战工作，将士们虽然不知道将要有什么行动，但那山雨欲来的气氛还是让所有人都感到紧张和兴奋。
为了严格保密，朱由检对任何人都没透露作战计划，除了蕊儿和戚美