中华军在剿灭了万丹伊斯兰王国之后，随后有灭亡了马打蓝国等其他几个小国，至此，爪洼岛上的所有势力都已经被中华军清理一空，而这里的华人的数量和吕宋相比还有一定的差距，但是当地的土著人的数量非常多。
而印尼群岛又是物产丰富的地方，蕴含着丰富的石油和各种矿产，并且还有十分丰富的橡胶资源。
而印尼群岛上面的原住民之中，建立了国家的地方特别多，因此相对于吕宋岛上的土著人来说，这里的局势跟家复杂一些，而中华军对待他们的态度也迥然不同，不再像之前对待吕宋岛上的土著人那样温和，而是采取了一种十分果决的策略，那就是施行人口消灭。
这个策略是项玉早就制定好了的，只不过他也没有想到中华军能够在这么早的时间就拿下这些岛屿，但是一些提前制定的方针还是没有动摇，印尼群岛上的人口数量众多，面积也比吕宋岛要大得多，因此中华军很难在当地维持大范围的驻军，而没有大量的军队，岛上的原始森林山川水泊就会给这些土著人提供庇护的场所，而等到他们缓过劲来，将会对中华军在各地的城市以及遍布各地的矿产工地产生很大的威胁，因此必须在这个时候中华军大军驻扎并且有能力解决的时候处理掉。
在爪哇岛的局势安定下来了之后，中华军兵分两路，分别从巴达维亚出发，向东和向西同时出发，主要是击溃当地的土著部落，并且将人口掳掠到巴达维亚来，这些人将被送去修建万丹到巴达维亚之间的道路，这两个城市是中华军在爪哇岛的重要支点，但是陆地上的交通条件十分的恶劣，到处都是原始森林和穷山恶水，而为了维护西爪哇岛的稳定。在陆地上修建一条道路是十分有必要的。
这两地之间的跨度将近一百二十公里，其实也不是特别远，但是沿途的丛林密布环境恶劣，还有十分严重的危险生物。包括犀牛、蛇以及蚊蝇的袭扰，中华军预计这条路要修通，最少要投入三十五万人，修建至少一年的时间，才能将这一代的丛林和山涧劈开。将两地之间的交通打通。
而这个人口数字是十分的庞大的，而且人力成本极高，古时候服徭役死人是非常常见的事情，因此这样的工作自然就落到了这些岛上的土著人的手中了。
中华军的行动十分顺利，应该说岛上的土著人根本就没有什么像样的抵抗能力，也有几个规模比较大的部落，但是他们的装备比较落后，因此在中华军的打击之下很快就败下阵来，沦为了中华军的俘虏。
很快，从岛上各个方向运过来的俘虏源源不断的被送往雅加达。中华军在占领了巴达维亚之后便将它的名字重新换了回来，雅加达这个名字听起来比巴达维亚这个欧洲名字好听多了。
这些俘虏有男有女，但是清一色的都是青壮年的劳动力，也有十五六岁的半大小子，年老体弱和衰老的土著人是见不到的，这些人都被中华军给处理掉了，这一政策让军队中很多人都感到不适，尤其是杀死那些只有几岁甚至是几个月大的小孩的时候，很多士兵都感觉有些于心不忍，但是下面的军官已经得到了严令。要严格的执行上面的命令，因此这些士兵虽然于心不忍，但是最后还是将这项任务完成了。
具体的进剿行动持续了三个多月的时间，爪哇岛上的人口数量并没有一个完整的统计。不过根据中华军的估计应该在四百万人左右，而据非公开的资料显示，中华军在这三个月的时间里面一共杀死了超过两百万人，其中包括一百多万的老人和儿童，这一数字是后世根据中华帝国解密的一些资料推测出来的，具体的伤亡人数谁也不知道。
因此这一项灭绝人口的行动被拿来和欧洲人贩卖黑奴。以及屠杀北美地区的印第安人一起，被列为世界上三大人口屠杀事件，受到了很多人的谴责。
即使是这样，这个时候聚集在雅加达的土著人的总数已经达到了一百多万，这还不算之前已经被派分出去开始修建雅万之路的十几万人。
这么多人聚集在雅加达，给城中的守军很大的压力，他们将这些土著人分散到城外的数十个大营中去，以免他们聚在一起产生意外，毕竟上百万的人而且都是年轻力壮的劳动力，一旦产生什么差池那简直就是要了老命。
雅加达这个时候也面临一个问题，那就是粮食的供应的问题，虽然中华军在清剿这些土著人的过程之中也缴获了大量的粮食，但是城外这一百多万张嘴，一天消耗掉的粮食就达到惊人的四五千石，换算成吨来计算的话将近两百五十吨，而雅加达并不是一个规模很大的城市，这个时候城中的存粮只有不到十万石，就算是加上之前中华军从万丹和这些部落中缴获的粮食，也不足三十万石，这样一来，城中的粮食很快就会耗尽。
土著人这个时候还是施行的最低配给制，一人一天也就给一斤大米的配给，而王佐才这个时候考虑到粮食的短缺情况，于是狠心将这个数字大砍了一番，直接将每人每天一斤米，砍成了只剩半斤米，这样一来仅仅只能维持这些人不被饿死，想要吃饱肚子显然是不可能的。
这样做虽然能够将粮食的供应时间延长一些，但是这样做也没什么实际的意义，因为这些俘虏们每天如果只吃这么少的粮食的话，他们根本就没有力气去劳作，每天还会白白的消耗掉这半斤米。
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