被鳌拜留下断后的蔡毓荣只抵挡了两日，就全军覆没，蔡毓荣在昌化兵败被俘，被明军以酷刑处死。
鳌拜都没想到蔡毓荣败得如此之快，清军撤退的道路并不好走，浙军斥候、闽军斥候、琼州军夜不收、山地兵，还有天地会的特工人员沿途骚扰，拖延了鳌拜撤军的时间。明军在击败了蔡毓荣之后，用骑兵沿着大道尾随追击，山地兵从两翼山林并行追击，一路追赶过去，杀死俘虏了不少落单的清兵。
鳌拜也非等闲之辈，见明军咬住自己的尾巴，便知蔡毓荣已经全军覆没。倘若任凭明军尾随和并行追击，清军一路败退过去，只能更加溃不成军，十多万大军能有三分之一逃回贵池就算不错了。于是鳌拜勉强组织了败兵，留下一部分兵力断后，结阵对抗明军。
刘国轩率领明军主力赶到，很快就击败了被鳌拜留下来断后的清军，明军又继续追击鳌拜主力，一路过去，杀的清军尸横遍野。
鳌拜毕竟是久经沙场的老将，不断抛出一些本来就打算放弃的绿营兵，留下来阻拦明军，减缓了明军追击的步伐。
清军主力惨败，为了减轻浙西和徽州一带压力，钱塘江以南的金华清军陈世凯和牟大寅等清将集结了金华温州等地绿营，凑集了三万多清军北上攻击杭州。但张煌言镇守杭州，明军以钱塘江天险为防线，浙南上来的清军连钱塘江都无法过去。
常熟、嘉善、松江、湖州等地投降明军的绿营清军得知鳌拜大败的消息，这些首鼠两端的家伙趁机出兵，扩大自己的地盘。
尽管那些投降明军的绿营清军战斗力不强，他们打打顺风仗还可以，而且苏州常州等地城池坚固，要攻打并不是一件易事，可是鳌拜大败的消息传来，苏州、常州等地清廷官员人心惶惶，本来这些地方留下的兵力就不多。就算是苏州、常州这样的大城也只有五六百绿营，一些县城只有一两百绿营，甚至没有绿营驻守。结果天地会安插在城内的内线趁机起事，同常熟方向出来的明军里应外合。这些投降明军的绿营清军趁势夺取了苏州、常州、太仓、平江、新阳等十几座城，为自己开拓了地盘。
对那些不久前刚刚投降的不稳定分子，王新宇目前还暂时没办法对他们进行整编，给他们的军队安插自己的沙子，既然他们去攻城夺地。那就让他们去好了，他们打下来的地盘也是属于明军的地盘，这样就帮王新宇开拓了新的地盘。
江宁的清军还是不敢轻举妄动，被留守在江宁的马国柱、麻勒吉等人不敢带兵出击攻打被明军占领的苏州等地，因为镇江到扬州这一线十分重要，郑成功为了对付鳌拜，主动放弃了不久前攻克的扬州，撤军江南，使得清廷的漕运线又恢复畅通。担心失而复得的漕运线再次被切断，大批清军集结镇江。来保护镇江的江面。
其实明军也没有更多的实力去切断漕运线，王新宇下一步计划是暂时回厦门和东番，处理郑经和郑袭内乱的事情。
王新宇暂时无力攻打镇江和江宁等地，目前王新宇手头已经拥有了十一万大军，不过这十一万人马中，出了一万五千琼州军和两万郑家军有攻坚能力，这三万五千精锐要调回厦门，去对付郑经和郑袭的内乱。剩下的明军，两万浙军打袭击战还可以，正面强攻坚城的话。实力还是不够。至于新编入明军的五万多新降绿营清军，那就不考虑了，他们只能守城，用那些人去攻打江宁之类的坚城。只能是白白送死。而且这些新投降的绿营将领军心也不稳，拿他们去当炮灰，会产生抵触心理。
同时王新宇还要准备琼州大海战，歼灭来犯的尚之信、吴六奇和洪承畴的主力。有潜伏在平南王府的内线来报，洪承畴打算趁着琼州军出击江南的机会，偷渡袭击琼州。一举击破王新宇的老巢。
而且根据内线汇报，洪承畴很可能是会亲自带兵！
“既然洪承畴这个老贼要来，那就最好了！能把洪承畴消灭在琼州，能宰掉这条老狗最好了！这是给江南百姓报了大仇啊！”王新宇得知这个消息，十分兴奋。
王余佑提议道：“其实留给我们的时间不多了！对付洪承畴和吴六奇，把闽军调去琼州。王将军你自己的琼州军，去厦门和东番平叛！江南就留给浙军和新降的绿营好了。”
“王先生言之有理！若是把闽军调去厦门和东番平叛，让他们去对曾经的同袍下手，恐怕军心会不稳，到时候反受其害，还是琼州军去平叛为妙，闽军调去对付洪承畴那老狗！另外秋收的稻谷已经收了上来，我们的军粮充足。只要我们在江南修建城池，张大人就能守住江南。”王新宇点头赞同了王余佑的看法。
厦门平叛一事已经迫在眉睫，郑成功的身体越来越差，倘若几日后得知郑经抗命不肯自尽的消息，恐怕郑成功会被当场气死。
不过现在还不能马上撤军，明军尚在追击鳌拜，必须要趁胜追击，尽可能大量的歼灭清军，等把鳌拜赶到贵池，王新宇才能腾出手来去厦门和东番平叛。但王新宇又担心如果去的晚了一步，不管是郑经获胜还是郑袭获胜，东番都将丢失，自己就失去了一个地盘，炮厂和新式武器的工厂都将落入对自己不怀好意的家伙手中，那样对自己就很不利。只有尽快解决内讧问题，才能放开手去对付清军。
攘外必先安内，在这时候是正确的战略思想。可以肯定一点，清廷肯定不