一年后，天宫市——
这是一个在空间震灾害中建起的城市。
吵杂的街道，喧哗的市区，各种各样的噪音夹杂在一起，充满了整个天宫市主要街道区的每一个角落，给人一种意外的生机勃勃之感，看起来很是平和。
然而，下一个瞬间——
“呜呜呜呜呜呜呜呜呜呜呜呜呜…………”一阵极其刺耳的警报声没有丝毫前兆的响彻在天宫市之内。
人们中止了一切的活动，都好像看到了史前巨兽一样，亡命的逃进了离他们最近的避难所里，被厚重的钢门护在了里面。街道上，一栋栋建筑物开始陷入了地面中。
不久后，街道的一角处围了这里！
天地间，只剩下震耳欲聋的爆炸声与猛烈的冲击波袭向了四面八方，摧毁着这里所有的一切！
等到冲击波与爆炸声停下时，留在原地的，只有被生生削出了一个大坑的地面。
“刚才这里好像发生了有趣的事情，啊？”拿着相机的穿着女子高中制服的灰色短发少女说道。
“哪里有趣了？搞不好这是我们来到这里造成的啊！”穿着山伏装，有着兽耳和大尾巴的白色“犬”娘有些惊慌的样子。
引发空间震的，是穿越了位面，来到这个世界的幻想乡新闻组——射命丸文和犬走椛。
“远处有人类飞过来了哦，还是快点闪人比较好一些吧？”椛拥有“千里眼”的能力，a的人还未到，就马上发现了。
“嗯，也是呢，小笨狗你给我把耳朵和尾巴收起来啊。”文文说着，隐去了自己黑色的翅膀，同时借用“千里眼”能力给a拍了一张特写供以后参考。
“啊……我知道的啦。”
两人边走边吵吵闹闹着，不过，在往这边来的，可并不只有a，一道青色的光芒忽然笼罩了两人。
“不好，是强制空间传……”
然后两人就消失了。
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时间稍作倒退，空中舰艇佛拉克西纳斯（fraxinus）——
这是一艘名字取自世界之树之树种，隶属于拉塔托斯克（ratato社捕捉杀死精灵相对的，为了与精灵对话、企求以和平的手段解决空间震所产生的灾害而集结成的神秘组织。
舰桥中，几个工作人员在尽职地操作着，坐在司令官位置上的，很奇怪的是个怎么看都是初中生的，用黑色发带扎着双马尾的红发少女，嘴中还含着棒棒糖。
但这确实就是司令官本人，五河琴里。
“分析结果出来了。”下面的工作人员之一，绰号是lt;保护监视处分gt;的箕轮梢说道，顺便说一下由于某些需要，这里的员工都是些绰号相当不靠谱的家伙。
“和识别名〈水神（suijin）〉那时候一样，没有过去‘现界’记录，没有灵波反应，可以确认是新的…………”
“又是这样啊，不是人类又不是精灵，还长着翅膀和兽耳兽尾什么的，妖怪吗？还这个世界到底又发生了什么异变啊？”琴里抱怨着。
“那，要，怎么做？”一边站着的一个高中生模样的蓝发男生问道，顺带一提，是看起来非常草食系的那种。
这是琴里的哥哥，五河士道。他在该组织中有着重要的使命——封印精灵，让精灵过上正常人的生活。目前已经成功封印了〈公主（prince）〉四糸乃两位精灵。
事实上是封印了三位，但另一位是琴里的小秘密。
虽然不久前还遇到了〈梦魇（nigare）〉时崎狂三，但狂三的目的只是士道封印的精灵之力，虽然有一年前发生在英国的那场精灵攻打dem总部而知道狂三是个凶暴型精灵而有些防备，但还是差点栽跟头，
拆穿后，狂三被〈水神（suijin）〉给揍了一顿……说是揍一顿也不算，因为双方受到的伤害并不大，之后狂三似乎就把目标转移到了〈水神（suijin）〉身上，对士道没这么感兴趣了。
不过也多亏了〈水神（suijin）〉，要不然琴里就要亲自出马收拾狂三，而导致自己是精灵的秘密曝光在哥哥面前了。
“嗯嗯嗯……拿着普通的相机啊，看起来她们应该有些常识的样子，将她们传送到我们的一个备用地下设施来谈谈吧。要是和那个正太是类似存在的话，就算不是精灵，却说不定会被狂三盯上呢。”琴里说道。
“那，我就不用出场了？”士道问道。
“不是精灵也封印不了啊……难道说，士道想要在妹妹允许的范围外扩充水晶宫吗？”琴里毒舌道。
“怎么可能啊！”
“好了，舰船暂时交给神无月指挥，我去去。为了预防万一将空中舰提升到随时可以战斗的状态。”说着，琴里起身离开了了舰桥，往传送室走去。
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拉塔托斯克地下设施，会客室——
琴里打量了一下突然被传送却很快就平静下来了的两人，说道：“你们，不是精灵吧？”
“不是啊。”文文说道，按照幻想乡划分的话，精灵可是比天狗低级的多的存在，这么说简直是侮辱了。
“那到底是什么？”
“按照人类的说法，叫做妖怪吧？”
“还真出妖怪啊？！那种神话的生物真的存在？”过去出现的〈水神（suijin）〉好歹检测出的还是和魔术师类似的魔力波动，在理解范围内，但妖怪什么的也太超常了。
而且说话相当的自然，还拿