第三次忍界大战以捕抓虚为终点，四国联军各自回国，牺牲了二十多条人命，换来疑似血继限界的躯块，不过战后更多的麻烦需要处理。
土之国与火之国的援助进入风之国，为了防止尚有战力的砂忍因为绝望而再次挑起战争，两国抓了些小国的民众进入风之国，外来的人口提供了些许的生产力，这让风之国足以继续维持。
至于风之国的新大名，其他几国经过一周的扯皮后找出了一个风之国的远房贵族，把他拱上大名的位子。
新大名臭着脸，身为贵族的他，原本在土之国也是个不小的地方官，结果天外掉下锅，让他从气候凉爽的高原被掉到炎热的沙漠。
在他一旁的是火之国派来的行政官，由他协调政府部门的运作。
新大名好奇问道:“我说，风之国大名好端端的，怎么突然就挂了，更离奇的是，大名不是都有子女、亲戚吗?怎么会轮到我当大名。”
行政官微笑道:”听说风之国发生大规模的瘟疫，大名与其家人很不幸的染病身亡，但其实是一名失控的忍者使用不知名的武器，造成风之国三成人口死亡。”
新大名听到是忍者干的，他瑟缩一下，平时在土之国，他就把忍者当作个工具，随便给点佣金就能让忍者处理些棘手的问题，没想到竟然有发狂的忍者杀了大名。
新大名认真问道”
行政官灿笑道:“不行。”
木叶一方虽然胜了，也败了，打赢胜仗本来能让火之国取得不少的报酬，不过火之国大名决定给手里的工具一点教训，减少了任务的报酬，虽然不多，但也够付出给所有参战的忍者。
顾问团松了口气，清除了动乱份子，又取得大名的原谅，接下来把脏水泼到大蛇丸身上，村子没受到任何损害。
木叶村外的墓园，纪念战争中丧命忍者的慰灵碑刻下所有亡者，纲手连同四名顾问上前致词。
卡卡西握住琳的手，带土也成为石碑上的一个名子，队友没有全灭让他没有像原作时放飞自我加入暗部。
卡卡西手放在左眼下，喃喃道:“带土，是你让我学会珍惜同伴，你给我了眼睛，你是我的眼。”
另一边的波风水门情绪相当低落，那个人的名子并没有刻上石碑，作为被村子放逐的他成为村民口中的耻辱。
玖辛奈与水门站在石碑前，她道:”那位前辈，是个善良的人，我无法相信他会成为叛忍。”
“现在我们只能先顾好自己，对了，如果我们生下小孩，该取什么名?”
“男孩就叫鸣人，女孩叫鸣子。”
结束之后，纲手回到家中，对断说道:”我要去找大蛇丸，把我们的孩子找回来。”
断以为自己没听清楚又问了一遍”
纲手拳头一握，发出劈啪的声响。
“我要把孩子找回来。”
纲手脑中回想到女儿天真的发问”
“女儿也到了进入忍者学校的年纪，我们两个不是说要一起看着孩子成长吗?”
“可是…。”
“其实你是对三代的作法感到气愤吧?纲手，你还是火影，你是木叶的领袖，为了孩子你更应该留在木叶。”
纲手一撒手，大声道:”那芽怎么办，他一个人被大蛇丸拐走，这十年来，我们再也没有听到他的下文、看到他的样貌、摸他的头发，他是我们的儿子阿。”
断抱过纲手，安慰道:”我也相当痛苦，但是相比于五万多人的木叶忍者村，纲手你更应该领导大家。”
“可是我开始怀疑我是否能真正的领导木叶，为了短期的利益而舍弃一部分的人，把他直接视为叛忍，陷他于追杀之中，我等于是杀害他的凶手。”
“我知道了，那妳就去吧，但你要答应我，自己照顾好自己，我会守护好我们的家。”
“谢谢你的支持，断。”
几天后，木叶忍者村群体哗然，纲手竟然主动辞去火影的位子，
离开的纲手在辞职后立刻离开木叶，只带上身为助理的静音消失。
做为第四代火影，纲手知道了太多机密情报，本来是不允许她辞去火影，但是顾问团在意见上产生了分歧，其他两名顾问对于纲手的作风感到排斥，种种革新的策略侵犯到他们认为的规范，一直以来，他们遵从二代忍者定下策略，对内以师徒制的方式选出优良的继承人，而作为交换，水户门炎与转寝小春放弃收徒而成为监督，对外取得更多委托以拓展影响力，同时拉拢雷之国分割整块大陆。
而三战之后，局面开始被打破，纲手自成的派系在胜利后的影响力逐渐放大，而外围的虚实力强但位处边缘，这才能为他们放弃他的理由，同时以此事件为开头，打击日益发展的医疗忍者势力。
有了现代科学的加入，一些本来不该出现的药物、设备、知识提前出现，纲手打算将这些新发明应用到所有村民上，而顾问倾向将这些作为军事用途，打算封锁消息，并将新事物限定在属于暗部的范围内。
而团藏巴不得纲手离开，纲手离开后，团藏能将势力深入火影直属的暗部，此外如果选出下一任的火影，团藏为有力的候选人之一，波风水门虽然呼声很高，但没有自己的势力且年资较浅，团藏认为自已还算有不小的机会。
最后就是猿飞日斩的态度，本应该极力拒绝的前任火影竟然批准了纲手的辞退，并且重新上位成为火影，木叶的政治生态又回到三代的时期。