虽然明末睁眼看世界、注意西学东渐的人很多，比如徐光启、李之藻等人，因为与西洋传教士接触频繁，所以对当时的欧洲各国颇为了解，但是这些人多从学术上特别是西方数学、天文、宗教等方面了解西方，对西方人的殖民野心却是警惕不够，直到葡萄牙人骗租了澳门，荷兰人强占了东番岛南端，甚至南居益在澎湖附近跟荷兰夷大了一场海战，明朝的君臣文武以及士大夫们，还是没有真正觉醒过来，还是没有认识到时代已经变了。
想到这些，如今这位崇祯皇帝对南居益说道：“卿与朕君臣相得，没有什么当讲不当讲，爱卿所思所想皆可对朕直言。”
南居益听了这话，躬身说道：“臣谢陛下知遇之恩！”
然后接着说道：“以臣之见，环顾今日之四海内外，我大明遭逢之时局，实乃中华数千年史上所未见。泰西诸夷，越洋数万里泛海而来，其所图谋，必然非小。而泰西诸夷皆海外异种，兼且船坚炮利、器物先进，又夷教固其心志，无法再待之如古之四方蛮夷，以文化之，变夷为夏。
“其人其国与我大明义利相侵，与我中华必不相容，今日其人可占爪哇、吕宋，可占澳门、东番，他日未必不会谋我东南、图我华夏。
“此皆臣肺腑之言，并非危言耸听，以惑陛下。请陛下慎思而明辨之。”
崇祯皇帝听完，默默地点了点头，他当然知道这绝非危言耸听，只是这种时代变局，不是一般人所能观察到的，即便是明朝那些较早睁眼看世界的士大夫也不是人人都能认识到的。
明朝没做好，最终被满清所取代，但满清的做法却更为失败，不仅闭关锁国，而且绝圣弃智，采取的完全是一种逃避的办法，闭上眼就当全世界都不存在，这也是最差劲的一种对待方式，让中国人彻底失去了与西方列强齐头并进，一争长短的机会。
结果不到二百年，取代明朝之后闭关锁国、绝圣弃智的满清王朝，还是逃避不了被殖民被掠夺的命运，而在被西方列强的坚船利炮轰开国门之后，让全体中国人所遭受的屈辱，更是亘古所未见。
而这一切的因果，早在满清入关的那一天起，就已经深深地种下了。
这一世的崇祯皇帝当然不会让这种最差的结局再发生，因此听完南居益的话，略作沉吟之后，对他说道：“爱卿所言，朕深为认同。朕虽身居宫中，但对外事并非一无所知。泰西诸夷不仅船坚炮利、器物先进，而且科学昌明，与我大明相比犹有过之而无不及。兼且有夷教约束，上下一心，惟以殖民海贸、对外开拓为能事。假以时日，必是我大明之大患。”
“沧海桑田，风云变幻，如今之天下，已非二百年前之天下，如今之时代，也非太祖高皇帝之时代，同样也不是永乐皇帝之时代了。我大明一家独大，以致独大于坤舆万国之局面，如今已然全数改变了。
“若我大明君臣不能洞察这个时代之变化，不能跟上这个时代之演变，则有如盲人骑瞎马，夜半临深池。若果真如此，则我大明危矣，我华夏亦危矣。”
说到这里，崇祯皇帝看了看在座的诸位重臣，看他们若有所思地垂首倾听，于是接着对南居益说道：“朝臣之中，对海上事务有所知者并不多见，卿可谓其中之佼佼者。对此，卿可有以教朕？”
“陛下如此说，臣恕不敢当！”南居益先是这么说了一句，然后接着说道：“以臣之见，欲抗西夷，必固海防，而欲固海防，则必兴水师。”
听南居益说到这里，崇祯皇帝点了点头，不置可否地说道：“此言朕亦知之。想我大明在永乐年间，水师舰队之盛，当世首屈一指，然而不过数十年，一切犹如过眼云烟，消散不见。朕若大兴水师，却又如何保证数十年之后，不会重蹈覆辙？”
南居益听皇帝如此说，知道眼前这个皇帝非一般人可比，光说大话空话，不仅完全没有用，恐怕还会引起皇帝对自己的不满，于是想来想去，干脆说道：“臣以为，三宝太监死后不数年而大明水师即一落千丈，不在于我大明不重水师，而在于我大明不能从水师大兴之中获利。
“天下熙熙，皆为利来，天下攘攘，皆为利往。自来大兴水师，所费不菲，若其不能为国获利而徒耗金银，即使英明如陛下，恐怕也不能长久。”
说到这里，南居益看看皇帝，略一沉吟，接着说道：“臣有一策，或可一举数得，既能扩我海疆、拓我版图，又能繁盛商贸、增加税赋，同时也可为大兴水师提供源源不断之强兵猛将。”
到了这个时候，崇祯皇帝才面色稍缓，微微笑着，对南居益说道：“卿有何策，尽管说来！”
只见南居益肃容说道：“臣本非两广、闽浙督抚，谈论此事颇有越俎代庖之感，既然陛下垂问，臣为陛下姑妄言之。
“我大明水师兴废轮替、难保长盛不衰，海寇袭扰不断、难以斩草除根，其根由皆在于朝廷之海禁。”
南居益说完这话，看皇帝不生气，反而不断点头，于是继续说道：“虽然隆庆以来，海禁日开，但我大明东南海疆长达数千里长，而仅开一月港，供海商往来贸易，其与未开并无太大不同。
“若陛下能大开海禁，鼓励海贸，在东南沿海海船停靠之处，海商云集之地开港口、设市舶、抽关税，则不仅闽广一带百姓谋生有路，而朝廷也可从中获利而大兴水师。如此一