消息传到京师，传进紫禁城，允炆心慌地差点从龙椅上跌下来。燕王讨伐的檄文景公公还未念完，他就急忙喝止住，不想再听下去。殿下群臣交头接耳，一片混乱。
齐泰大骂燕王，他的嗓门本就大，再一咄嗟叱咤，整个殿宇都是他如雷般轰隆隆的声响。允炆挥挥手，示意景公公宣了退朝。齐泰急忙劝慰，请求应战。允炆却不想与他说话，他有自己的考量。
允炆心里想得不只是燕王，而是所有的藩王，所有的皇叔。每个人少则兵力一两万，多则十来万。若他们联合起来，从四周包围京师，那么当初说燕王一隅之地的人，说他以卵击石的人，都该改口说自己如此是也了吧。
真是用人不善。早就知道齐泰只会夸夸其谈，偏偏还错信他。要不是齐泰用人不当，要不是自己用他不当，何以让燕王涨了威风，又灭了自己的志气？“今幼主嗣位，信任奸佞，横起大祸”，允炆回想着檄文里的话，竟不由得赞同起来。
允炆刚走出奉天门，齐泰不顾护卫阻拦，争抢到他面前：“皇上，事态迫在眉睫，皇上势必早下决断。”
“爱卿言之有理。”允炆瞪他一眼。说着就令人摘他乌纱帽，扒下官服。革了他所有官职，命他从此不得再踏进皇城一步。
齐泰目瞪口呆，方孝孺、黄子澄急忙跪劝。允炆却心意已决，不容争辩。
各位藩王中，除了燕王宁王，拥有军事实力的还有辽王朱植、谷王朱橞和晋王朱济熺。对于济熺，允炆倒不担心。亲自写了封信派人送去，着他严守边关，以防外敌。济熺一看就明，立即上了一份表，陈情自己的忠心。
允炆又给辽王和谷王发了诏令，两位的藩地与北平遥望相对，万一他们参与靖难，后果实在不可想象。幸而这两位明辨是非，一见诏令，都立马交了兵权。举家绕开燕王，来了京师。
辽王原来就藩广宁，早就厌倦了边塞的苦寒。他请求改封，择选了一处山清水秀，四季分明之地——湖北荆州。允炆欢喜地准了，拨了三百护卫护他前往，供他差使。
而谷王则请求留在允炆身边，他要支持允炆，保护他，为抵抗靖难出一份力。因为贬为庶人的代王朱桂是谷王的同胞亲弟，他想清证自己与朱桂完全不一样，对朝廷对允炆他是死心踏地，绝无二心。允炆心里又落了一块石头，高兴地给谷王指派了三千兵力，派遣他驻守京师南边的金川门。
可是罢免了齐泰，燕王并没有收兵。而是以破竹之势，迅速攻取了北平以外的很多州县，率领燕军直逼河北。
如何这般快？每天传回来的奏报在一张一张地叠加，全是被夺被攻，抵挡不住的消息。允炆心乱如麻，不知所措。他习惯了事事都如品茶下棋一般，细细回味思虑再三之后再下决断。可这战事瞬息万变，一步对策还没想好，对方却已连发数招，夺了他一角之地。
“真是阴险小人。”黄子澄骂将道。他早就坐不住，天天围着允炆请求发兵。齐泰犯了大错，他不敢替他辩护。但只要拿下燕王，就能力挽狂澜，为齐泰将功赎罪。
“爱卿认为何人可去？”允炆问道。
“曹国公。”黄子澄答。李景隆之父李文忠可谓一代英雄豪杰，他所向披靡，战无不胜，是大明开国功臣之一。而李景隆，虎父无犬子。朝野之中，他最是年轻气盛，英武不凡。更重要的是，早年李景隆跟随他父亲和燕王一起在塞外打过北元，对燕王的作战方式最是了解。黄子澄说得头头是道。
但允炆却想得比他多。燕王反了，还有那么多藩王没有表态。他们或许在静观其变，或许在伺机行动。李景隆正如黄子澄所说是最佳统帅，那就更该把他留在身边，保卫自己，保卫京师。而对付燕王，允炆想到了另外的人选，那就是长兴侯耿炳文。
因为耿玮的事，允炆感觉和耿炳文之间生疏了很多。而此时正是个契机，重用他可显示自己对他的倚重，另一方面也正好考验耿炳文是不是对自己还持有忠诚。允炆这么一想，当即拿定了主意。
他先令方孝孺写书祭告太庙，削燕王朱棣宗室属籍，废为庶人，剥夺他一切俸禄和兵权。再任命耿炳文为征虏大将军，领兵三十万正面出击讨伐朱棣。另外又指派辽王和谷王交出的兵力，分别从东北和西北包抄北平。如此这般，可教朱棣无处遁形，插翅难逃。
耿玮过世一转眼就快两年，若说耿炳文心里不计较倒也不真。但君臣之礼重于父女之情，耿炳文临危受命，也是一点不敢有丝毫懈怠。
可是想象是美好的，现实却是残酷的。征调的兵力只凑到十多万，眼看时间紧迫，耿炳文在催促之下只得匆匆上阵，先行开拔去了河北。而此时的他已是垂暮之年，寒冬时节从南方长途跋涉到北方，年轻的士兵将领颇多水土不服，耿炳文更是疲累。
然而，屋漏偏逢连夜雨。未及出战，底下将领已经出了叛徒。不但逃往燕地归顺了朱棣，还将他部兵排阵的计策统统出卖了个干净。不消多日，援军还没等到，耿炳文就给击败得一路退守，直退到黄河边上的真定，闭门固守起来才算保住了残余的主力。
朱棣大喜过望，不过他一向也清楚防守城池是耿炳文的看家本领，这也就鸣金收兵，暂且作罢。
而围困北平的几万人马，却也是迟迟攻克不下。替朱棣镇守北平的是原燕世子朱高炽，他肥胖臃肿