十九路军主力南撤，古田守军陷入绝境。按老蒋的原定军事部署时对古田发动佯攻，诱使蔡廷锴率主力增援，围城打援，在闽北全歼十九路军主力，一举奠定胜局。但是没想到蔡廷锴没有上当，果断率军南撤，老蒋的如意算盘落空，遂下令总攻古田。
同时老蒋暗令金钊，在仙游阻击十九路军南撤，并信誓旦旦的说，如果金钊能在仙游抵抗十九路军一天，等到中央军大军一到，必能将十九路军歼灭于仙游一带。金钊自然不会相信老蒋的鬼话，再者说金钊也没有投靠老蒋的意思，于是便以部队兵力不足且过于分散，短时间内难以集结为由委婉的拒绝了。
驻守古田的是人民革命军第五军第七师，师长赵一肩。而中央军进攻古田的是张治中部的第八十七师和八十八师，水口战役结束后，老蒋又调三十六师和八十九师近抵古田外围的槐门亭。同时命令第三师，第十师在水口附近策应。
老蒋下达总攻古田的命令后，张治中却迟迟不下令进攻。这是因为张治中想用和平的方式争取赵一肩不战而降，以免生灵涂炭。因为张治中所部曾与十九路军在淞沪战场上并肩作战，不忍于当年生死与共的兄弟部队自相残杀。而当时赵一肩身为十九路军参谋长，和张治中感情不错，有了这段香火情，于是张治中便亲自给赵一肩写了一封信劝降。
张治中在信中以大义相责，以利害相劝，望其悬崖勒马，早日归顺中央。而此时十九路军主力南下，古田守军孤立无援，赵一肩权衡利弊之后，最终接受了张治中的劝降，于1月11日，出城投降。
张治中“古田释兵”，不费一枪一弹，拿下古田。赵一肩第七师投降，至此谭启秀的第五军等于全军覆灭，闽北战事宣告结束。
就在闽北交战正酣之际，远在厦门的十九路军参谋长兼厦门市长黄强亦不战而降，于1月9日通电宣布支持中央，并请求厦门海军要塞司令林国庚接管厦门。但是，1月9日晚上，驻守厦门的十九路军特务团发动兵变，特务团营长周大山率兵占领团部和厦门市政府，逮捕了黄强及特务团团长李金波，同时为了稳定厦门局势，周大山以叛乱投敌，贪污受贿，陷害抗日领袖等罪名，将黄强和李金波秘密枪毙。
蔡廷锴在接到消息之后，立刻任命周大山为厦门警备司令。随后周大山率领特务团与林国庚的海军旅战旅在厦门发生激战。战斗至1月10日上午，林国庚部不敌，退回厦门港内。同时向海军司令陈绍宽求援。陈绍宽当即电令，鱼雷游击纵队司令王廷率逸仙，中山，江宁等舰及海军陆战队一部驰援厦门。
金钊将手中的电报递给林惠元，笑着说道，“惠元兄（没查到林惠元的字，就暂且这么称呼吧！），黄强和李金波都已经伏法了，恭喜你沉冤得雪！”
林惠元接过电报认真看了一遍，周大山在处决了黄强等人后，随即在厦门张贴告示，宣布黄强等人的罪状，其中详细介绍了黄强等人陷害林惠元的经过，至此林惠元沉冤得雪。林惠元拿着电报激动不已的说道，“多谢孟博兄！大恩不言谢！日后惠元愿为将军执鞭坠马，万死不辞！”
“惠元兄客气了，大家都是为了革命嘛！像黄强这样的败类，早该伏法了！”金钊笑着摆摆手说道。